Biomining je metoda vađenja minerala i metala iz njihovih matičnih ruda korištenjem prirodnih bioloških procesa. Praksa ne zahtijeva niti jedan od procesa štetnih za okoliš koji se nalaze u konvencionalnim metodama rafiniranja, već se u potpunosti oslanja na prirodnu interakciju bioloških organizama. Proces se također pokazao učinkovitim u održivom vađenju minerala iz rude niskog stupnja i jalovine koja se prije smatrala neupotrebljivom. Biomining se sastoji od dvije različite tehnike pročišćavanja: bioluženja ili biooksidacije. Iako biološko pročišćavanje minerala pokazuje veliko obećanje u obradi niza elemenata, većina aktivnosti biominiranja trenutačno je usmjerena na ekstrakciju bakra i zlata.
Konvencionalne metode ekstrakcije minerala oslanjaju se na primjenu otrovnih kemikalija u prisutnosti ekstremno visokih temperatura; takvi procesi često za sobom ostavljaju naslijeđe uništavanja okoliša, bolesti i smrti. Ti su čimbenici potaknuli potragu za čišćim i sigurnijim metodama dorade u skladu s rastućom globalnom težnjom prema zelenim rješenjima. Biomining je postao jedan od onih koji najviše obećavaju i ne uključuju ništa više od potpuno prirodnih bioloških procesa jer je učinkovitost. Ove metode pročišćavanja zahtijevaju malo intervencije za pokretanje, ne proizvode toksične nusproizvode ili emisije i ne zahtijevaju vanjske izvore goriva. Predstavljena mikrobnim procesima ispiranja i oksidacije, biološka ekstrakcija minerala ima mnoga potencijalna područja primjene, ali se trenutno uglavnom koristi za preradu zlata i bakra.
Proces bioluženja, jedna od dvije tehnike pročišćavanja, klasičan je primjer jednostavnosti metoda biominiranja. Ruda niskog stupnja odlaže se u hrpu poznatu kao leach hrpa i natopljena je slabom otopinom sumporne kiseline. Kisela reakcija sa sulfidnim matriksom rude potiče rast bakterijskog soja Thiobaccilus ferrooxidans koji razgrađuje rudu i oslobađa metalne ili mineralne naslage u tekućoj otopini. Ova tekućina bogata mineralima se skuplja i odvaja, a zaostala sumporna kiselina ponovno se koristi za sljedeći ciklus ispiranja.
Druga metoda biominiranja, biooksidacija, naširoko se koristi za pripremu vatrostalne rude koja nosi zlato za ekstrakciju. Ovaj proces uključuje izlaganje rude bakterijskoj oksidaciji koja razgrađuje inače netopive komponente pirita i arsena. To omogućuje preradu rude korištenjem daleko manje agresivnih metoda sa smanjenim ekološkim implikacijama. Ova vrsta koristi dovela je do ubrzanog razvoja biominiranja kao održive alternative glavnom rafiniranju minerala s 25% sadašnje svjetske proizvodnje bakra u biominiranju. Taj će se trend zasigurno nastaviti kako globalni pritisak raste da potrošači i dobavljači postanu ekološki odgovorniji.