Muški mokraćni sustav, ili sustav izlučivanja, sastoji se od bubrega, mokraćnog mjehura, mokraćovoda i uretre. Svrha muškog mokraćnog sustava je prikupljanje i izlučivanje tekućeg otpada iz tijela u obliku mokraće. Mokraćni sustav muškaraca malo se razlikuje od ženskog mokraćnog sustava zbog međusobne povezanosti genitalija.
Bubrezi se nalaze u stražnjem dijelu trbušne šupljine neposredno ispod donjih rebara i iznad donjeg dijela leđa. Na obje strane tijela nalazi se po jedan bubreg. Bubrezi su u obliku graha i otprilike su veličine šake odraslog čovjeka.
Primarna funkcija bubrega je prosijavanje otpadnog materijala i viška vode iz krvotoka. Unutar bubrega nalaze se malene strukture za preradu otpada nazvane nefroni, koji su odgovorni za proizvodnju urina. Unutar nefrona nalaze se sićušne krvne žile zvane glomeruli, koji djeluju kao filteri koji čuvaju zdrave krvne komponente i izbacuju toksine i otpadne proizvode.
Urin napušta bubrege kroz dvije cijevi koje se nazivaju ureteri. Jedan ureter nalazi se u sredini oba bubrega na strani organa koji su okrenuti prema kralježnici. Protežu se niz tijelo i spajaju na stražnji dio mjehura.
Mokraćni mjehur ili mokraćni mjehur prikuplja i zadržava mokraću. To je proširivi, šuplji i mišićavi organ koji se nalazi na dnu zdjelice, koji se također naziva zdjelična dijafragma. U mokraćnom sustavu muškaraca, mjehur leži između rektuma i pubične simfize, što je hrskavični zglob koji spaja dijelove stidnih kostiju.
Mokraćni mjehur muškaraca nalazi se iznad prostate, što je struktura koja nije prisutna kod žena. U ženskom mokraćnom sustavu, mjehur se nalazi ispod maternice na vrhu rodnice. Muški mjehur je veći i može zadržati veću količinu urina od ženskog mjehura.
Urin napušta mjehur preko mišićne cijevi zvane uretra. U muškom mokraćnom sustavu, uretra se proteže od mjehura do kraja penisa. U ženskom mokraćnom sustavu, uretra se proteže od mokraćnog mjehura do otvora neposredno iznad otvora vaginalne šupljine. Muška mokraćna cijev služi kao put do mokraće i sjemena i znatno je duža od ženske uretre. Zbog veće duljine muške uretre, podijeljena je na četiri dijela radi identifikacije: preprostatična mokraćna cijev, prostatična uretra, membranozna mokraćna cijev i spužvasta uretra.