Postoje četiri moguće komplikacije ERCP-a. Endoskopska retrogradna kolangiopankreatografija (ERCP) je medicinski postupak koji se provodi za dijagnosticiranje i liječenje poremećaja žučnih ili pankreasnih kanala. Komplikacije koje mogu nastati tijekom ili neposredno nakon operacije su: pankreatitis, perforacija crijeva, pretjerana sedacija i alergijska reakcija na boju korištenu tijekom zahvata. Komplikacije ERCP-a rijetko su ozbiljne ili opasne po život.
ERCP je i dijagnostički alat i sustav za isporuku liječenja. Korištenjem endoskopije, kamera pričvršćena na dugu, tanku cijev šalje se kroz usta i u tanko crijevo. Nakon što endoskop ubrizga posebnu boju u žučne kanale, kirurzi mogu locirati začepljene kanale, tumore, žučne kamence i strikture, ili uska područja, korištenjem x-zraka. Ako kirurg otkrije jedan od ovih problema, može ukloniti žučne kamence, umetnuti stent ili proširiti strikturu tijekom istog postupka. Iako su komplikacije ERCP-a rijetke, pacijenti bi ipak trebali biti svjesni što može poći po zlu.
Pankreatitis, upala gušterače, javlja se u otprilike pet posto pacijenata koji su podvrgnuti ERCP-u. Javlja se kada endoskop prenosi enzime za probavu hrane iz tankog crijeva u gušteraču. Stanje može biti vrlo bolno. Budući da je pacijent koji ga doživi zbog ERCP-a već hospitaliziran, liječnici mogu davati lijekove protiv bolova i IV tekućine dok se stanje ne povuče nakon jednog do dva dana.
Perforacija crijeva je rizik svih endoskopskih operacija. Razbijanje tkiva tijekom postupka može dovesti do unutarnjeg krvarenja. Kada se perforacija crijeva dogodi tijekom ERCP-a, kirurzi je općenito primjećuju kada boja curi iz gušterače ili žučnih kanala. Ako je rez dovoljno mali, moguća je endoskopska operacija.
Prekomjerna sedacija je još jedna od komplikacija ERCP-a. Budući da endoskop mora proći kroz želudac da bi došao do kanala, pretjerana sedacija može rezultirati mučninom i povraćanjem nakon operacije. Povraćanje može biti izuzetno bolno, jer većina pacijenata osjeti bol u trbuhu dan nakon zahvata. Nizak krvni tlak je još jedan rizik od prekomjerne sedacije. U većini slučajeva, liječnici će od pacijenata koji povraćaju ili imaju nizak krvni tlak zahtijevati da ostanu u bolnici još dan ili dva.
Od svih komplikacija ERCP-a, alergijska reakcija na kontrastnu boju koja se koristi tijekom zahvata je najrjeđa. To je zbog činjenice da prijekirurški probir i pregled otkrivaju pacijentove alergije. Iako je alergija obično blaga, kirurzi mogu davati antialergijske lijekove ako primjete da pacijent ima alergijsku reakciju tijekom operacije.