Mogu postojati brojni uzroci hipnagoških halucinacija, uključujući nuspojave ovisnosti o drogama, gutanje ili udisanje raznih otrovnih tvari, a ponekad i lijekove koji se izdaju na recept ili bez recepta. Ove halucinacije najčešće doživljavaju osobe koje su bile žrtve raznih poremećaja spavanja ili imaju psihičke probleme u prošlosti ili sadašnjosti. Paraliza u snu također može biti razlog za hipnagoške halucinacije, koje se mogu pojaviti istovremeno ili odvojeno. Paraliza sna je stanje u kojem se um budi, sprječavajući osobu da utone u dovoljno dubok san da zapravo sanja.
Hipnagoške halucinacije nazivaju se halucinacijama koje se javljaju neposredno prije spavanja ili neposredno prije buđenja. To se može smatrati problemima koje ljudi osjećaju ili doživljavaju između spavanja i buđenja. Uključuju živopisne senzacije, trzanje tijela kako bi se iznenada probudili, viđenje velikih ili ravnodušnih slika koje se čine nestvarnim, te čuti glasove neposredno prije spavanja. Ove su halucinacije češće u mladih ljudi, osobito u djece, a mogu uzrokovati ozbiljne probleme ako potraju dulje vrijeme pa je potrebno zakazati konzultacije s liječnikom.
Kao i kod mnogih drugih vrsta mentalnih problema, ovisnosti o drogama mogu uzrokovati pojavu ovih halucinacija. Lijekovi na recept, kao i gutanje ili udisanje otrovnih tvari, također su uključeni u ovaj odjeljak jer svi uzrokuju promjene u mozgu i njegovom funkcioniranju. Kemikalije koje koristi mozak mijenjaju se u takvo stanje da izazivaju ove vrste halucinacija. Postoje i razne vrste mentalnih poremećaja koji mogu uzrokovati iste vrste reakcija unutar mozga, zbog čega je neophodno potražiti stručnu pomoć kada se pojave hipnagoške halucinacije. Bilo da se radi o problemu s drogom ili problemu mentalnog zdravlja, potrebno je pronaći i ispraviti uzrok kemijskih promjena.
Konačni uzrok ovih halucinacija može biti jednostavan poput ozljeda glave ili leđa koje pogađaju živce koji vode u mozak. Ozljeda glave ili kralježnice također može uzrokovati da kemikalije u mozgu prestanu ispravno funkcionirati, osobito ako su određeni živci stegnuti. Kao što je već rečeno, zato je potrebno konzultirati liječnika kada hipnagoške halucinacije postanu problem. Iako osnovni simptomi mogu biti samo smetnja, temeljni problem može biti ozbiljniji i treba ga izolirati i eliminirati.