Stomatolozi često propisuju antibakterijsku vodicu za ispiranje usta kako bi smanjili mikrobe u ustima koji uzrokuju gingivitis, uobičajenu bolest desni. Verzija bez recepta koristi velike količine alkohola umjesto antibiotika i ima više antiseptički učinak. Iako je većina ovih oralnih lijekova sigurna, mogu se pojaviti nuspojave. Antiseptička sredstva za ispiranje bez recepta dostupna su za one bez ozbiljnih bolesti koji žele izbjegavati alkohol.
Većina ljudi koristi vodicu za ispiranje usta za zadah iz usta ili loš zadah, uzrokovan uglavnom djelovanjem bakterija na naslage plaka ili čestice. Otpuštaju spojeve sumpora koji uzrokuju neugodan miris. Halitoza također može biti posljedica vrlo suhih usta, pušenja ili zdravstvenih stanja poput dijabetesa i respiratornih bolesti. Osobe s trajnom halitozom trebale bi posjetiti liječnika kako bi bili sigurni da se temeljni problem može liječiti.
Za ozbiljnija stanja poput gingivitisa, stomatolozi mogu propisati antibakterijsku vodicu za ispiranje usta zajedno s režimom poboljšane oralne higijene. Ova sredstva za ispiranje mogu sadržavati tetraciklin, antibiotik za ubijanje bakterija, heksetidin koji smanjuje iritaciju i krvarenje, a ponekad i anestetik protiv bolova. Nistatin je antifungalni lijek koji se često propisuje za Candidu, gljivični organizam koji uzrokuje drozd.
Utvrđeno je da klorheksidin glukonat, antiseptik u antibakterijskoj vodici za ispiranje usta i bez recepta, inhibira rast klica plaka. Rezultati traju samo nekoliko sati. Antiseptik za ispiranje trebao bi nadopuniti dobru oralnu higijenu, kao što je redovito četkanje i čišćenje koncem, a ne zamijeniti ga. Redovita njega pomoći će smanjiti pojavu halitoze koja nije uzrokovana drugim zdravstvenim stanjem. Međutim, rijetko je potrebna antibakterijska vodica za ispiranje usta koja sadrži antibiotike za liječenje češćih uzroka lošeg zadaha.
Mnoge vodice za ispiranje usta bez recepta sadrže alkohol koji ubija klice, ali isušuje sluznicu u ustima. Neki znanstvenici vjeruju da alkoholna vodica za ispiranje usta doprinosi nastanku karcinoma usne šupljine, budući da su stope veće od prosjeka uočene kod kroničnih osoba koje piju. Poznato je da kronični alkoholičari ponekad zlorabe vodicu za ispiranje usta kada je alkohol u drugom obliku nedostupan i može unijeti više od prosječnog korisnika. Od 2011. godine nije dokazana definitivna veza između upotrebe vode za ispiranje usta s visokim udjelom alkohola i raka usne šupljine.
Antibakterijska vodica za ispiranje usta može imati iste nuspojave kao oralni lijek u obliku tableta. Neki ljudi su alergični na tetraciklin i druge antibiotike. Mogu doživjeti ozbiljnu reakciju s oticanjem lica i grla te problemima s disanjem. Poznato je da klorheksidin boji zube pri dugotrajnoj uporabi. Pacijenti također mogu imati želučane tegobe, proljev i loš okus u ustima.
Ako pacijentima nije potrebna antibakterijska vodica za ispiranje usta, postoje alternative antisepticima na bazi alkohola. Biljni pripravci dostupni u trgovinama zdrave hrane sadrže bilje ili ksilitol, prirodni zaslađivač s nižim glikemijskim indeksom od šećera. Mnogi ljudi se zaklinju u otopinu jedne čajne žličice soli u jednoj šalici tople vode kao ekonomično i učinkovito ispiranje za liječenje grlobolje ili blagih ozljeda i infekcija u ustima. Stomatolozi također mogu preporučiti sigurne pripravke bez alkohola za djecu.