Preglednik genoma je web sučelje koje se koristi za pregled fizičke karte kromosoma. Ova karta pokazuje koliko DNK razdvaja dva gena, mjereno u parovima baza. Ljudski kromosomi imaju raspon od 50 milijuna do preko 250 milijuna parova baza. Preglednik genoma prikazuje shematske prikaze cijelih kromosoma, kao i “povećane” sheme pojedinačnih gena, pa čak i stvarne sekvence para baza.
Preglednik genoma omogućuje korisniku da se kreće po kromosomu i zumira određena mjesta. Mnogi preglednici genoma dopuštaju korisniku zumiranje na razini gledanja stvarne sekvence DNK, iako je stvarna korisnost preglednika u mogućnosti da pregleda gene u njihovom širem kontekstu, umjesto da vidi sekvencu DNK na razini nukleotida. Prosječna veličina gena je 3,000 parova baza, tako da kada se zumira na razini baznog para, korisnik će vidjeti manje od cijelog gena. Najveći ljudski gen, distrofin, dug je 2.4 milijuna parova baza.
Osim pregledavanja shematskih prikaza gena, preglednici genoma mogu prikazati i druge korisne informacije. To može uključivati dio gena koji je preveden u protein, nazvan mRNA, i DNK sekvence koje imaju druge funkcije osim kodiranja proteina. Preglednik genoma također može pokazati koji su segmenti DNK korišteni u procesu sekvenciranja genoma.
Velik broj organizama ima sekvencionirane genome. Ne postoji niti jedan preglednik koji je standardan za područje genomike, tako da preglednici genoma mogu varirati između sekvenciranih genoma. Preglednici genoma imaju funkciju traženja gena ili sekvenci od interesa, dopuštajući korisniku da skače s jednog genomskog mjesta na drugo. Ne bi bilo učinkovito pomicati se po kromosomu da biste došli do mjesta od interesa zbog vrlo velike veličine većine kromosoma.
Neki preglednici genoma imaju alate koji se nazivaju sorteri gena. Ovaj alat prikazuje tablicu gena koji su međusobno povezani. Odnos može biti jedan od nekoliko tipova: homologija sekvence, sličan profil ekspresije ili genomska blizina. Korisnik traži gen pomoću riječi ili izraza, odabire vrstu odnosa koji želi, a razvrstavač gena prikazuje rezultate pretraživanja.