Šesta čakra, poznata na sanskrtu kao ajna, često se obično naziva čakra trećeg oka, a kaže se da se nalazi na čelu, neposredno iznad nosa. Prema ljudima koji prakticiraju kundalini i druge oblike joge, ova čakra je tjelesni centar za duhovne energije koje se odnose na točnu percepciju, razumijevanje i mentalnu oštrinu. Kaže se da energije šeste čakre imaju utjecaj na oči, mozak, epifizu i hipofizu. Vjeruje se da neravnoteže ili blokade u ovoj čakri dovode do migrene, gubitka vida, neugodnih snova i naprezanja očiju. Praktikanti jogijske umjetnosti vjeruju da pozitivno razmišljanje, pjevanje mantri i izvođenje obrnutih i ravnotežno orijentiranih joga poza mogu ukloniti blokade iz šeste čakre i uravnotežiti njezine energije.
Kaže se da energije šeste čakre imaju snažan utjecaj na um i, prema tome, na endokrini sustav. Praktikanti joge često vjeruju da su um i tijelo intrinzično međusobno povezani, tako da mentalno stanje može imati moć utjecati na fizičko stanje. Prema tim uvjerenjima, vjerojatnije je da će onaj tko njeguje pozitivne misli i miran, kontroliran um uživati u dobrom fizičkom zdravlju.
Vjeruje se da je čakra trećeg oka odgovorna za sposobnost percipiranja i razumijevanja stvarnosti. Vjeruje se da poremećaji u čakri trećeg oka uzrokuju poremećaje u percepciji i odvajanje od stvarnosti. Vjeruje se da negativne misli i emocije, poput straha, proizlaze iz poremećaja u energetskoj ravnoteži šeste čakre.
Mnogi praktičari joge vjeruju da je prikladno držanje od vitalnog značaja za čišćenje šeste čakre i balansiranje njezinih energija. Vjeruje se da neprikladno držanje, u kojem se glava smije stršiti naprijed, pridonosi blokiranju čakre trećeg oka. Također se kaže da je kultiviranje pozitivnih misli i uvjerenja vrlo korisno za pravilno funkcioniranje čakre trećeg oka. Kaže se da su afirmacije i mantre koje koriste korijenski zvuk “om” korisne za fokusiranje energije čakre trećeg oka.
Ljudi koji prakticiraju hatha jogu obično vjeruju da joga poze orijentirane na ravnotežu mogu koristiti čakri trećeg oka. Vjeruje se da poze kao što je poza plesača pomažu smirivanju i fokusiranju uma. Vjeruje se da obrnute poze, kao što je stajanje na ramenu, smiruju um i pomažu čakri trećeg oka.