Najprepoznatljiviji znak herpesa kod muškaraca je prisutnost kvržica ili mjehurića na genitalijama ili anusu. Međutim, muškarac može imati simptome prije nego što može vidjeti prepoznatljive kvržice herpesa; koža genitalija muškarca često postaje nadražena i crvenila prije nego što se pojave. Na kraju se kvržice pretvaraju u mjehuriće i na kraju se mogu pretvoriti u otvorene rane. Nakon nekog vremena čireve obično prestanu krvariti ili curiti tekućinu i prekrivaju se kraste. Nakon što rane zacijele, možda neće biti drugih simptoma do sljedećeg izbijanja, što se može dogoditi tjednima kasnije ili ne dok ne prođu mjeseci ili čak godine.
Mnogi ljudi vjeruju da će muškarac uvijek imati čireve na penisu ako ima herpes, ali to je zabluda. Herpes može uzrokovati pojavu kvržica i ranica ne samo na penisu, već i na skrotumu. Rane se čak mogu razviti u analnom području i na bedrima oboljelog muškarca. To znači da vizualni pregled penisa možda neće biti dovoljan da se uvjeri da seksualni partner nema herpes. To također znači da upotreba kondoma možda neće pružiti 100-postotnu zaštitu od ove spolno prenosive bolesti.
Vrijedi napomenuti da jedan od simptoma herpesa kod muškaraca može biti kvrga ili ranica koja je skrivena od golog oka. Te se kvržice ponekad formiraju unutar muške uretre. Uretra je cijev kroz koju urin prolazi na svom putu iz tijela.
Odsutnost kvržice ili rane na genitalijama, anusu ili okolnim područjima ne znači nužno da muškarac ne može prenijeti herpes na seksualnog partnera. Virus je moguće prenijeti čak i kada zaražena osoba nema simptome i nije ih imala već duže vrijeme. Dodatno, virus je moguće širiti i heteroseksualnim i homoseksualnim kontaktom, a može se prenijeti i oralnim seksom.
Zanimljivo je da muškarac može imati herpes, ali biti potpuno nesvjestan da je zaražen. To se može dogoditi kada je početna epidemija previše blaga da bi bila primjetna. To se također može dogoditi kada muškarac ima tešku početnu epidemiju, ali nikada ne posjeti medicinskog stručnjaka radi dijagnoze. Budući da bi mogle proći godine prije nego što ponovno doživi simptome herpesa, možda neće shvatiti da ima spolno prenosivu bolest.