Komplikacije ulkusa u želucu i crijevnom traktu uključuju krvarenje, perforaciju ili crijevnu blokadu. Svaki od ovih problema može izazvati dodatne komplikacije. Ponekad komplikacije ulkusa zahtijevaju operaciju, ali u drugim slučajevima lijekovi mogu biti sve što je potrebno da se problemi s ulkusom stave pod kontrolu. Ulkusi u ustima i dijabetičko stopalo također mogu predstavljati ozbiljne komplikacije.
Blago do teško unutarnje krvarenje može nastati ako čir ošteti krvne žile jer izjeda sluznicu želuca ili tankog crijeva. Količina krvi ovisi o veličini krvnih žila koje su oštećene. Krvarenje može proći neotkriveno ako su oštećene krvne žile male. Ako se krvarenje u probavni trakt nastavi nekontrolirano, pacijent će vjerojatno razviti anemiju. Kada je oštećenje većih krvnih žila, unutarnje krvarenje može biti ozbiljno i obično je potrebna hitna liječnička pomoć.
Ostale komplikacije čira na želucu uključuju perforaciju i infekciju. Kod perforiranog ulkusa, koji pogađa oko 10 posto ili manje pacijenata oboljelih od karcinoma, čir prodire kroz stijenku želuca ili tankog crijeva i dopušta da sadržaj želuca iscuri u trbušnu šupljinu. To može uzrokovati infekciju poznatu kao peritonitis. Osoba s peritonitisom obično će imati iznenadne, oštre bolove i trebat će hitnu hospitalizaciju i operaciju.
Začepljenje crijeva javlja se u 5-8% osoba s komplikacijama peptičkog ulkusa. Ako se čir nalazi u blizini dvanaesnika, koji povezuje želudac s tankim crijevom, može doći do otekline i/ili ožiljaka. To dovodi do začepljenja crijeva koja sprječava kretanje sadržaja želuca kroz probavni trakt. Blokada obično uzrokuje da pacijent često povraća neprobavljenu hranu i uzrokuje osjećaj nadutosti i neobjašnjivog gubitka težine. Moguća je hitna hospitalizacija zbog crijevne blokade.
Liječenje crijevne blokade ovisi o rezultatima endoskopije i onome što liječnik može vidjeti na mjestu blokade. Ako je blokada posljedica otekline, pacijentu se obično daju inhibitori protonske pumpe ili antagonisti H2-receptora kako bi se smanjila oteklina. Općenito, operacija nije potrebna.
Ako je začepljenje posljedica ožiljaka, osobito ako je ozbiljno, pacijentu će biti potrebna operacija za uklanjanje ožiljnog tkiva i izbjegavanje daljnjih komplikacija ulkusa. U blagim slučajevima, operacija se može izvesti kroz endoskop umetnut u grlo i niz probavni trakt. Nakon što se ožiljno tkivo ukloni, želudac se ponovno veže na preostalo tanko crijevo bez ožiljaka, a hrana ponovno može slobodno teći kroz probavni trakt.
Čirevi u ustima, dijabetički čir na stopalu i dekubitusni ulkusi, također poznati kao prolećne rane, druge su komplikacije. Ulkusi u ustima, iako rijetki, dovode pacijenta u opasnost od bakterijskih infekcija. Ulkusi dijabetičkog stopala zahtijevaju temeljito čišćenje i njegu te antibiotike kako bi spriječili razvoj infekcije i gangrene. Ako liječenje dijabetičkog ulkusa ne uspije, ud će možda trebati amputirati kao posljednji rezultat. Nepokretni bolesnici mogu razviti čireve koje dovode do ulkusnih komplikacija infekcije, gangrene, kao i niza drugih zdravstvenih problema.