Postoje razne nuspojave dojenja, dobre i loše. Iako se negativne nuspojave često mogu liječiti, nekim ženama mogu otežati dugotrajno dojenje. Jedna od najčešćih pritužbi je pojačana glad, jer tijelo treba više kalorija tijekom dojenja. Suhe, ispucale bradavice također mogu biti problem. Naravno, postoje neki pozitivni učinci dojenja, uglavnom snižene razine estrogena u tijelu, što može dovesti do kašnjenja menstruacije i smanjenja rizika od određenih karcinoma.
Jedna od najčešće spominjanih nuspojava dojenja je naizgled stalna glad. To je zato što tijelo sagorijeva 500 do 800 kalorija dnevno samo dojenjem, što zahtijeva od dojilja da svaki dan pojedu najmanje 500 kalorija više nego što su jele tijekom trudnoće. Oni koji to zanemare mogu biti posebno gladni, a vjerojatno će i njihova zaliha mlijeka početi opadati. Naravno, riješiti se ove nuspojave obično je jednostavno jer samo zahtijeva dodavanje barem jednog malog obroka u prehranu. Dodavanje nekoliko zdravih zalogaja umjesto dodatnog obroka također može obaviti posao.
Mnoge dojilje imaju suhe, ispucale bradavice, osobito tijekom prvih nekoliko tjedana. To može učiniti dojenje bolnim iskustvom, čak i uzrokovati da neke majke potpuno prestanu. Ženama s ovim problemom obično se savjetuje korištenje kreme za dojenje koja se može nanijeti u bilo koje vrijeme, čak i neposredno prije dojenja, jer se smatra sigurnom i za bebu. Ako je jedna bradavica lošija od druge, možda bi bilo dobro dojiti više s druge strane kada je to moguće kako bi bradavica dobila priliku zacijeliti. Iako je ovo jedna od najbolnijih nuspojava dojenja, također se smatra jednom od najizlječivijih.
Neke nuspojave dojenja zapravo su pozitivne, potičući žene da doje što je duže moguće. Na primjer, estrogen je obično uvelike smanjen tijekom tog vremena, što obično rezultira kašnjenjem menstruacije. Naravno, to se ne događa svakoj ženi, niti uvijek znači da je ovulacija prestala, pa se kontracepcija često savjetuje i u slučaju izostanka menstruacije. Povezana korist je smanjenje rizika od raka dojke i jajnika, koji je uzrokovan smanjenom razinom estrogena. Stoga, što žena dulje doji, to je manji rizik za ove vrste raka.