Najčešći uzrok neugodnog mirisa vaginalnog iscjetka je infekcija. Na primjer, određene vrste spolno prenosivih bolesti (STD) mogu uzrokovati iscjedak koji neugodno smrdi, iako neke ne mogu uzrokovati nikakve simptome. Zanimljivo je, međutim, da žena može imati infekciju koja se ne prenosi spolnim putem, ali ipak uzrokuje neugodan miris. To se može dogoditi, na primjer, kada bakterije koje su inače prisutne u rodnici prekomjerno rastu i uzrokuju infekciju. Ponekad je neugodan miris čak uzrokovan prisutnošću stranog tijela, poput tampona koji je predugo ostao u rodnici.
Većina žena ima blagi prirodni miris u vaginalnom području koji se također može proširiti na njihov iscjedak. U većini slučajeva, međutim, ovaj se iscjedak ne smatra neugodnim mirisom; obično je prilično blagog mirisa. Međutim, ako žena ima iscjedak neugodnog mirisa, to može biti znak neke vrste infekcije. Neke od infekcija koje mogu uzrokovati iscjedak neugodnog mirisa su spolno prenosive, ali mnoge nisu.
Jedan od najčešćih uzroka smrdljivog vaginalnog iscjetka je infekcija koja se zove trihomonijaza. Trihomonijaza je spolno prenosiva i uzrokovana je parazitom. Iscjedak koji se javlja kada je žena zaražena često je sivkaste, žućkaste ili čak zelenkaste boje i obično je vodenaste konzistencije. Žena također može imati svrbež u tom području kada ima ovu infekciju, kao i bol ili krvarenje tijekom ili nakon spolnog odnosa. Mogu se javiti i bol tijekom mokrenja i oticanje vaginalnog područja.
Bakterijska vaginoza je još jedna infekcija koja može uzrokovati bjelkasti ili sivkasti, smrdljivi iscjedak. Ova infekcija se razvija kada bakterije koje su inače prisutne u rodnici prekomjerno rastu. Ne prenosi se uvijek seksualnom aktivnošću, jer ga razviju neki ljudi koji nisu seksualno aktivni. Uz neugodan iscjedak tipičan za ovu infekciju, žena može osjetiti vaginalni svrbež, bol ili peckanje tijekom mokrenja ili spolnog odnosa te abnormalno vaginalno krvarenje kada ima ovu infekciju.
Također se može razviti vaginalni iscjedak neugodnog mirisa zbog prisutnosti stranog tijela u rodnici. Na primjer, ako žena zaboravi da nosi tampon kada joj završi menstruacija, on bi mogao ostati neprimijećen dugo vremena. Konačno, može uzrokovati infekciju, sa simptomima kao što je vaginalni iscjedak koji loše miriše, a također je smećkast ili crn.