Peyerove zakrpe su područja specijaliziranog tkiva u donjem dijelu tankog crijeva koja rade na razlikovanju prijatelja od neprijatelja dok hrana prolazi kroz gastrointestinalni trakt. Osjetljive stanice unutar ovih područja identificiraju antigene i odlučuju jesu li bezopasni, povezani s hranom koju osoba konzumira za ishranu ili štetni i povezani s organizmima poput bakterija koje bi mogle pokušati kolonizirati tijelo. Peyerove zakrpe prenose riječ ostatku crijevnog trakta, olakšavajući probavu i unos hranjivih tvari ili napad imunološkog sustava na napadača.
Postoji 30 do 40 Peyerovih mrlja, a sve sadrže limfoidno tkivo s visokim udjelom bijelih krvnih stanica. Drugo limfoidno tkivo, poznato kao limfoidno tkivo povezano s crijevima (GALT), može se naći u drugim dijelovima crijeva. Kada su ljudi mladi, ta su područja vrlo vidljiva i lako ih je razlikovati. Starenjem imaju tendenciju da blijede i postaju manje izraženi.
Peyerove mrlje imaju oblik malih jajolikih čvorića koji oblažu crijeva. Kako hrana prolazi, antigeni u hrani se prezentiraju tkivu i ono određuje da li ih ono prepoznaje i kako su klasificirani. Osim prepoznavanja antigena i pokretanja odgovarajućeg odgovora, Peyerove zakrpe također mogu naučiti identificirati nove antigene, pohranjujući te informacije za buduću upotrebu kako bi imunološki sustav bio učinkovitiji.
Ponekad imunološki sustav postaje zbunjen oko identiteta antigena s kojima je u interakciji. Može pogrešno misliti da je antigen poput proteina koji se nalazi u kikirikiju zapravo štetan i izazvati odgovor kada se taj antigen identificira. Odgovor dovodi do upale jer zbunjeni imunološki sustav pokušava neutralizirati ono što misli da je štetni napadač. Alergije na hranu mogu rezultirati reakcijama koje variraju od blage nelagode u crijevima do po život opasnog šoka uzrokovanog pretjerano željnim imunološkog sustava.
Imunološki sustav tretira crijeva kao izvan tijela, unatoč činjenici da je čvrsto i jasno smještena u trbuhu. Smatra se točkom kontakta s vanjskim svijetom jer će sve što ljudi jedu i piti doći u crijeva. To stvara rizike jer ljudi mogu konzumirati bakterije, viruse, gljivice i druge štetne organizme zajedno sa stvarima koje namjeravaju jesti. Mnoštvo GALT-a u crijevima osmišljeno je kako bi pružilo prvu liniju imunološke obrane kako bi spriječio ulazak štetnih organizama u tijelo.