Kasna menstruacija može biti posljedica mnogih različitih čimbenika. Najčešći uzroci uključuju trudnoću, dojenje, menopauzu, nuspojave lijekova, debljanje ili gubitak težine, bolest te fizički i psihički stres na tijelu. Dok se normalna menstruacija obično javlja između 11 i 13 puta godišnje za većinu žena, druge prirodno imaju dulje cikluse. Najbolje je konzultirati se s liječnikom ako dođe do neredovite ili kasne menstruacije, osobito za bolesnice koje bi mogle biti bolesne ili trudne.
Trudnoća, dojenje i menopauza najčešći su prirodni uzroci kasne menstruacije. Tijekom trudnoće tijelo čuva endometrij, ili sluznicu maternice, koja se razvija u placentu kako bi osigurala prehranu rastućem fetusu, umjesto da se izluči tijekom procesa menstruacije. Žene koje doje također mogu imati neredovitu menstruaciju, jer hormoni uključeni u dojenje potiskuju ovulaciju i rast endometrija. Menopauza, proces kojim žene postupno prestaju ovulirati i menstruaciju, može biti još jedan čest uzrok kašnjenja menstruacije kod žena koje su u perimenopauzi, često u dobi između 45 i 55 godina.
Za žene koje nisu trudne, doje ili nisu u perimenopauzi, novi lijekovi ili promjene doze mogu biti glavni uzrok kasne menstruacije. Mnogi lijekovi, uključujući hormonske kontracepcijske pilule, mogu ometati prirodne hormonalne cikluse žene i u početku odgoditi menstruaciju. Neke kontracepcijske pilule osmišljene su za potpuno suzbijanje menstruacije, dok druge to mogu učiniti nehotice. Drugi lijekovi, posebno lijekovi povezani s hormonima, također mogu stvoriti nepravilnosti u ženskom ciklusu.
Stres je također čest uzrok izostanka menstruacije, bilo da se radi o mentalnom stresu, poput anksioznosti, ili fizičkom stresu, poput bolesti ili promjena u prehrani i tjelovježbi. Dobivanje i gubitak težine ponekad mogu uzrokovati i kasnu menstruaciju. Bilo kakav gubitak težine može iscrpiti tjelesne zalihe masti, smanjujući količinu estrogena u krvotoku i potencijalno odgađajući menstruaciju. Naglo povećanje tjelesne težine može biti simptom neke druge bolesti, poput hipotireoze ili sindroma policističnih jajnika (PCOS), a oba mogu uzrokovati kašnjenje menstruacije.
Promjene u prehrani i tjelovježbi mogu uzrokovati ne samo gubitak težine i debljanje, već i pothranjenost ili promijenjene razine hormona. Prehrana siromašna hranjivim tvarima često može dovesti do potisnute ovulacije i menstruacije, jer tijelo usmjerava svoju energiju na preživljavanje umjesto na reprodukciju. Drugi faktori stresa, kao što su putovanja, pritisak na poslu, promjene spavanja ili teške emocionalne situacije, također mogu dovesti do kasne menstruacije. Ove situacije mogu aktivirati tjelesni odgovor na stres ili ometati sposobnost tijela da održi određene razine hormona.