Howard Hughes Medical Institute (HHMI) je neprofitna medicinska istraživačka organizacija posvećena biomedicinskim istraživanjima i obrazovanju. Institut je jedna od najvećih filantropskih organizacija u Sjedinjenim Državama i obično svake godine distribuira stotine milijuna američkih dolara (USD) za potporu znanstvenog istraživanja. Njegova je misija približiti čovječanstvu razumijevanju temeljnih pitanja o životu.
Rođen 1905., Howard Hughes smatran je briljantnim i ekscentričnim čovjekom, a postao je milijarder. Uzeo je skromno nasljedstvo i svoju vlastitu tvrtku, Hughes Aircraft Company, pretvorio u jednog od najvećih obrambenih izvođača u Sjedinjenim Državama. Njegovo najveće postignuće bilo je osnivanje Medicinskog instituta Howard Hughes sa sjedištem u Chevy Chaseu u Marylandu.
Hughes je osnovao institut 1953. i odredio organizaciju sa specifičnim područjima biomedicinskih istraživanja koja će biti podržana od strane tog instituta. Početna područja fokusa uključivala su genetiku, staničnu biologiju, strukturnu biologiju, neuroznanost i imunologiju. Godine 1987. institut je postao najveća privatna organizacija posvećena poboljšanju znanstvenog obrazovanja u SAD-u. Nastavio se širiti i počeo je uključivati studije u transformacijske znanstvene programe.
Jedna od primarnih misija Medicinskog instituta Howard Hughes je davanje bespovratnih sredstava pojedincima i institucijama u znanstvenoj zajednici. Cilj ovih potpora je promijeniti način na koji se znanstvena istraživanja provode te se poučava i razumije znanost. Od 1988. godine institut je dodijelio više od 1.4 milijarde USD bespovratnih sredstava.
Njegova je druga primarna misija pomicati granice znanstvenog istraživanja u različitim područjima, uključujući proučavanje bolesti poput tuberkuloze (TB) i virusa ljudske imunodeficijencije (HIV). Programi koje je ustanovio institut uključuju istraživače s Medicinskog instituta Howard Hughes, znanstvenike u ranoj karijeri, istraživački kampus farme Janelia, Collaborative Innovation Awards, Međunarodnu inicijativu za TB/HIV i međunarodne istraživačke znanstvenike.
Program istraživača je vodeći biomedicinski istraživački program instituta, a u njemu je zaposleno nekoliko stotina istraživača s punim radnim vremenom. Svaki od njih ima zadatak razviti poseban biomedicinski istraživački program. Istražitelji su uključili više od desetak dobitnika Nobelove nagrade.