Razdoblje inkubacije HPV-a vrijeme je između izlaganja jednom od više od 100 humanih papiloma virusa i prve pojave simptoma. Ovi simptomi su obično ili bradavice na genitalijama ili abnormalne kožne izrasline koje uzrokuju rak na penisu ili cervikalnoj regiji. Teško je odrediti točno razdoblje inkubacije jer se ono značajno razlikuje, čak i među istim tipovima virusa. Iako mnogi pacijenti mogu pokazati simptome unutar dva do tri mjeseca nakon izlaganja, ponekad se prvi simptomi neće pojaviti nekoliko godina. Drugo, kraj razdoblja inkubacije HPV-a može se propustiti ako se ne provode redoviti pregledi kao što je PAP bris, budući da oblici ovih virusa koji uzrokuju rak možda u početku nemaju nikakve očite znakove. Zbog toga se ženama koje imaju spolni odnos s više partnera, obično u dobi od 30 godina, savjetuje da godišnje rade PAP bris, koji može otkriti tipove HPV-a koji uzrokuju neobične kožne izrasline na vratu maternice i mogu pomoći u ranom otkrivanju raka vrata maternice.
Nepravilnost razdoblja inkubacije HPV-a je izazovna. Ljudi izloženi virusu možda će morati pričekati nekoliko godina prije nego saznaju da su ili nisu zarazni. S druge strane, kada pacijenti pokažu znakove jednog od ovih virusa, možda neće znati kada su ga zarazili. Pacijent je mogao biti izložen prije mjesec dana, godinu dana ili duže, što sugerira da bi svi partneri trebali biti obaviješteni barem u posljednje dvije godine.
Općenito, mnogo je lakše otkriti rane znakove ovih virusa nego odrediti stabilno razdoblje inkubacije HPV-a. Preporuka za redovite PAP briseve važan je dio detekcije, ali je također vrijedno pregledati vanjske genitalije i prijaviti liječnicima sve znakove bradavica, koje mogu biti pojedinačne ili mogu rasti zajedno. Oni koji misle da su možda bili izloženi HPV-u trebali bi rano posjetiti svoje liječnike, a fizikalna procjena unutarnjih genitalija ili vagine i anusa može otkriti bradavice koje nisu odmah vidljive.
Lako je pretpostaviti da prisutnost bradavica sugerira da je razdoblje inkubacije HPV-a završilo nekanceroznim oblikom HPV-a. Suprotno tome, prisutnost genitalnih bradavica dovodi ljude u veći rizik za kancerogene oblike ovih virusa jer povećavaju opći rizik da su pacijenti bili izloženi više od jednog oblika HPV-a. Preporuke liječnika o kontinuiranim kontrolama ako se otkrije bilo koji tip genitalnog HPV-a treba se pomno pridržavati.
Ljudi s najmanjom vjerojatnošću da će dobiti HPV su oni koji nisu seksualno aktivni ili koji su u dugotrajnim monogamnim partnerstvima. Oni koji će najvjerojatnije dobiti jedan ili više ovih virusa imaju više seksualnih partnera. Korištenje muških ili ženskih kondoma može pomoći u smanjenju rizika. Drugi pristup je cijepljenje ljudi protiv virusa, što može pomoći u prevenciji nekih od kancerogenih oblika HPV-a, ali je dostupno samo ženama.