Rijetke kožne bolesti često su ograničene na izolirane dijelove svjetske populacije. Mnogi liječnici, uključujući dermatologe koji su specijalizirani za liječenje kože, mogu provesti cijelu svoju karijeru ne susrećući se ni s jednim primjerom od stotina vrsta rijetkih kožnih bolesti koje postoje. To je zbog činjenice da se obično javljaju samo u šačice ljudi na svaki milijun ljudi u ljudskoj populaciji. Te bolesti uključuju recesivnu distrofičnu bullozu epidermolize (RDEB), lišaj Tinea imbricata ili Tokelau, koji se nalazi samo u plemenu Mindanao na Filipinima, i Stevens-Johnsonov sindrom (SJS) koji se javlja kao nuspojava na lijekove i može se vidjeti samo u šačice ljudi na milijun. Rijetki poremećaji kože mogu imati genetske, ekološke ili nepoznate uzroke, i, iako mnogi nemaju poznati lijek, neki se lako liječe nakon što se identificiraju.
Morgellons je primjer među rijetkim kožnim bolestima za koju se slabo razumije, ali se vjeruje da je uzrokovana nekom vrstom infekcije. Uzrokuje lezije kože, kao i druge štetne učinke kao što su gubitak pamćenja i bol u zglobovima, a identificiran je u otprilike 2,000 do 4,500 ljudi unutar američke populacije od 307,000,000 od 2011. Kao i nekoliko rijetkih kožnih bolesti, ne postoji poznati lijek za Morgellons, koji je 2001. godine prvi put identificirala Mary Leitao, majka dvogodišnjeg djeteta koje se zarazilo u Pennsylvaniji, SAD.
Unutar plemena Mindanao u provinciji Sarangani na Filipinima, Tinea imbricata je uzrokovana gljivičnom infekcijom tokelauskog lišaja. Ona proizvodi neku vrstu ljuskavog uzorka pilinga kože nalik otisku prsta koji se može proširiti na velike dijelove tijela, ali koji reagira na konvencionalne tretmane kada se identificira. Od 1990. godine u svijetu su prijavljena samo tri slučaja bolesti, a jedan se proteže čak do 1789. godine. Međutim, od 28. godine otkriveno je najmanje 2011 osoba koje su zaražene bolešću. a svi novi slučajevi bili su unutar plemena Mindanao.
RDEB je bio primjer među rijetkim genetskim bolestima neizlječivog stanja sve do 2010. godine, kada je 10 djece liječeno od njega u SAD-u matičnim stanicama dobivenim iz koštane srži. Dijagnosticirana je bolest RDEB-a u oko 20 novorođenih beba u Sjedinjenim Državama na svakih 1,000,000 živorođenih, a međunarodni napori liječnika iz SAD-a, UK-a i Japana radili su na liječenju i mogućim izlječenjima za nju od 2010. Dok se osmero od 10 djece oporavilo, dvoje je umrlo, a medicinska istraživanja su u tijeku kako bi se poboljšale metode liječenja. Poput mnogih rijetkih kožnih bolesti, poznato je da RDEB prvenstveno pogađa djecu jer njegovi rezultati mogu biti toliko ozbiljni da obično rezultiraju ranom smrću. Bolest čini kožu vrlo osjetljivom na trenje, što uzrokuje stvaranje mjehura i struganje, a ovaj učinak također se javlja na unutarnjim površinama kože kao što su usta i jednjak, što može rezultirati ekstremnom boli za takve osnovne aktivnosti poput jela.