Iako crni vaginalni iscjedak nije tipičan za većinu žena, njegovo povremeno pojavljivanje rijetko je razlog za uzbunu. U većini slučajeva radi se o staroj krvi zaostaloj od menstruacije ili implantacije embrija. Također može signalizirati strano tijelo u vagini, poput starog tampona ili kondoma, što je problem koji se obično brzo rješava tako što liječnik uklanja predmet. U nekim slučajevima, međutim, crni vaginalni iscjedak znak je raka vrata maternice, zbog čega se svaki abnormalni vaginalni iscjedak treba prijaviti liječniku osim ako je uzrok odmah očit.
Jedan od najčešćih razloga za crni vaginalni iscjedak je taj što je stara krv zapela u vratu maternice. Općenito, što je krv tamnija, to je duže u cerviksu, a normalno je da nekoj krvi nakon menstruacije treba danima ili čak tjednima da izađe iz rodnice. Ako menstruacija kasni i umjesto nje je prisutan crni vaginalni iscjedak, to bi moglo biti implantacijsko krvarenje. To se događa nakon što se jaje oplodi, stvarajući embrij koji se implantira u sluznicu maternice; ovo može izvući krv koja može biti ružičasta, smeđa ili crna, ovisno o tome koliko je stara. Nakon implantacije, kućni test trudnoće trebao bi biti točan.
Neke žene mogu imati strani predmet u rodnici koji ne primjećuju dok ne vide crni vaginalni iscjedak. Predmet koji se najčešće zaglavi u vagini je zaboravljeni tampon, iako kondomi također mogu skliznuti i ostati skriveni unutra. Kada je to slučaj, iscjedak je često popraćen neugodnim mirisom. Pacijenti mogu sami pokušati ukloniti predmet, ali posao može obaviti i liječnik. U većini slučajeva nakon uklanjanja stranog tijela nema trajnih posljedica, a iscjedak bi trebao prestati ubrzo nakon uklanjanja.
Rak vrata maternice mogući je, iako rijedak, uzrok crnog vaginalnog iscjetka. To je zato što je jedan od glavnih simptoma abnormalno vaginalno krvarenje, koje opisuje krvarenje nakon menopauze i između menstruacija u žena u reproduktivnoj dobi. U mnogim slučajevima, krvarenje je popraćeno neugodnim mirisom, osobito ako je krv neko vrijeme bila u cerviksu, što bi bio razlog da pocrni. Žene bi trebale biti svjesne da rak vrata maternice često ima malo – ako ih ima – simptoma, pa iako je malo vjerojatno da je to uzrok crnog vaginalnog iscjetka, problem bi trebao provjeriti liječnik.