Ekologija mora grana je ekološke znanosti koja se bavi organizmima koji žive u oceanu ili blizu njega, njihovim ponašanjem i interakcijama s okolišem. Opseg istraživanja u ekologiji mora može varirati uvelike, od ispitivanja jednostaničnih mikroorganizama do istraživanja globalnih učinaka onečišćenja i ljudske aktivnosti. Znanstvenici bi mogli promatrati određenu populaciju organizama, identificirajući njihovo ponašanje i odnose, ili istraživati cijela morska staništa kako bi vidjeli kako različiti živi i neživi čimbenici doprinose cjelokupnom ekosustavu.
Istraživači koji proučavaju morsku ekologiju često se usredotočuju na ponašanje i prilagodbe životinja. Na primjer, znanstvenik bi mogao promatrati određenu populaciju morskih organizama kako bi otkrio kako pronalaze hranu, pare se, komuniciraju s drugim vrstama i prilagođavaju se uvjetima okoline. On ili ona mogu ponovno posjetiti skupinu organizama tijekom vremena kako bi procijenili njihov reproduktivni uspjeh, obrasce migracije, broj populacije i njihove odgovore na različite vrste vremena.
Znanstvenici koji su specijalizirani za ekologiju ekosustava mogli bi provesti mjesece ili čak godine istražujući određenu regiju, kao što je obala, kako bi otkrili različite utjecaje koje žive i nežive komponente imaju na lokalni okoliš. Oni istražuju različite vrste autohtonih biljaka i životinja i njihove interakcije unutar ekosustava. Morski znanstvenici često razmatraju učinke neživih varijabli, kao što su svjetlost, temperatura i salinitet vode, na populacije živih bića. Oni također mogu pokušati utvrditi kako ljudska djelovanja i alohtone morske vrste utječu na dobrobit ekosustava.
Osim terenskih promatranja i studija, ekologija mora može se odvijati u laboratorijskim uvjetima. Morski ekolozi obično koriste mikroskope i drugu laboratorijsku opremu za analizu uzoraka tla, zraka, vode i žive tvari. Oni mogu pokušati utvrditi kako su se razina onečišćenja ili kvaliteta vode mijenjala tijekom vremena i kako su se različiti organizmi prilagodili takvim promjenama okoliša. Laboratorijski znanstvenici proučavaju bakterije, alge ili druge mikroorganizme kako bi saznali više o njihovoj ulozi u ekosustavu.
Mnogi morski ekolozi rade za vladine agencije i neprofitne ekološke organizacije kako bi promicali napore očuvanja i zaštite. Stručnjaci za morsku ekologiju koji rade za vladu često održavaju obilaske, govore i seminare kako bi educirali širu javnost o važnosti morskih ekosustava i što ljudi mogu učiniti kako bi ih bolje zaštitili. Oni koji rade za neprofitne organizacije mogli bi voditi projekte čišćenja kako bi obnovili oštećene obale i bazene za plimu. Obrazovana, zabrinuta populacija može poduzeti mnoge korake kako bi osigurala da će morske biljke, životinje i njihov okoliš nastaviti napredovati.