Koristi se gotovo isključivo u vrhunskim sigurnosnim aplikacijama, skeniranje mrežnice koristi izvor svjetlosti niskog intenziteta i osjetljivi senzor za skeniranje uzorka krvnih žila na stražnjoj strani mrežnice, uzorka jedinstvenog za svakog pojedinca. Iako je još 1930-ih bilo poznato da svaka ljudska očna jabučica ima jedinstvene karakteristike, tek je 1984. prvi skener retine postao dostupan za komercijalnu upotrebu. Proizvela ga je EyeDentify, tvrtka osnovana 1976. godine, koja je još uvijek primarni proizvođač ovih uređaja.
Tijekom skeniranja mrežnice, korisnik mora skinuti naočale, buljiti u određenu točku i držati glavu mirno 10-15 sekundi koliko je potrebno za dovršetak skeniranja. Ovu vrstu skeniranja vrlo je teško krivotvoriti jer ne postoji tehnologija koja dopušta krivotvorenje ljudske mrežnice, a mrežnica umrle osobe prebrzo propada da bi se koristila za lažno zaobilaženje takvog skeniranja.
Skeniranje mrežnice dio je biometrije, područja znanosti i inženjerstva koje razvija načine za jedinstvenu identifikaciju pojedinačnih osoba. Najpopularniji oblik biometrije koji se danas koristi je naravno otisak prsta, iako je stopa pogreške za identifikaciju otiska prsta ponekad čak 1 na 500. A
skeniranje mrežnice, s druge strane, ima stopu pogreške od 1 na 10,000,000. Njegov bliski rođak, skeniranje šarenice, nešto je manje precizno, održavajući stopu pogreške od približno 1 na 131,000.
Tradicionalno korišteno za blokiranje fizičkih pristupnika, kao što su oni koji čuvaju jezgre elektrana ili vojnih instalacija, skeniranje mrežnice se u posljednje vrijeme koristi za zaštitu kritičnih računala i njihovih podataka. Skeniranje mrežnice košta samo 220 dolara, što ga čini pristupačnim za svakoga tko želi održati visoku razinu sigurnosti. Nadalje, to je vjerojatno najtočnija dostupna biometrija, koja daleko nadmašuje otisak prsta i po pouzdanosti i po točnosti.