Većina kompleta za izolaciju ribonukleinske kiseline (RNA) može izolirati visokokvalitetnu RNA iz širokog raspona tkiva i vrsta organizama, uključujući biljke, životinje i viruse. Mitohondrijska i ribosomalna RNA — mRNA i rRNA, respektivno — mogu zahtijevati specijalizirane komplete za izolaciju RNA specifične za male niti RNA. Ostali čimbenici koji se mogu razlikovati među različitim kompletima za izolaciju su količina uzoraka koju svaki komplet može obraditi i vrijeme potrebno za potpunu obradu uzorka.
Najčešći tipovi kompleta za izolaciju RNA mogu se koristiti za širok raspon primjena, bez obzira na to odakle RNA dolazi. Stanice i tkiva sisavaca među najvećim su izvorima koji se koriste za izolaciju i pročišćavanje RNA. Biljne stanice i virusi također se koriste u eksperimentima molekularne biologije koji zahtijevaju upotrebu kompleta za izolaciju RNA.
Nakon što se uzorak tkiva ili krvi prikupi, mora se pripremiti za izolaciju RNA tijekom kritičnog procesa poznatog kao stanična degradacija, odvajanje ili prekid. Ako stanični materijal nije dovršen poremećen, proces izolacije RNA će proizvesti manje RNA. Najbolji kompleti za izolaciju RNA uključuju materijale i zalihe za staničnu degradaciju prije izolacije i pročišćavanje RNA nakon izolacije.
U posebnim slučajevima kada eksperiment zahtijeva mRNA ili rRNA, dostupni su specijalizirani kompleti za izolaciju RNA za lance RNA koji su posebno mali. Materijali i zalihe uključeni u takav komplet mogu se razlikovati po količini i veličini. Ovi kompleti za izolaciju RNA rjeđi su od višenamjenskih RNA kompleta i može postojati znatna razlika u cijeni.
Mnogi uobičajeni kompleti za izolaciju RNA dizajnirani su za korištenje sa svim vrstama tkiva i stanica i mogu dovršiti reakciju unutar otprilike 20 minuta. Vrijeme potrebno za potpunu staničnu degradaciju može varirati ovisno o tome gdje su u organizmu stanice prikupljene. Osim koraka stanične degradacije, proces izolacije RNA i naknadno pročišćavanje relativno su standardni u smislu postupka i vremena.
Još jedna značajka koja može biti specifična za određene komplete je količina uzorka potrebna za obradu reakcije. Dok neki setovi za izolaciju mogu zahtijevati relativno veliki volumen uzorka, drugi setovi mogu dobro funkcionirati s manjim volumenom. Ova razlika može biti prednost ako je volumen uzorka ograničavajući faktor.
Nekoliko proizvođača kompleta za izolaciju RNA ima usporedne karte dostupne na Internetu. Ovi se grafikoni mogu koristiti za uvid u razlike između različitih kompleta koje proizvode. Razlike mogu uključivati specijalizirane vrste primjene, kemikalije i potrebne količine uzoraka.