Imati kvalitetnu podzemnu vodu znači više od čiste vode. Uzima u obzir i mineralni sadržaj vode. Kvalitetu podzemne vode kontroliraju mnogi čimbenici, uključujući onečišćenje, ali postoje tri glavna čimbenika koji doprinose kvaliteti podzemne vode: klima, dubina vode te tlo i sediment.
Prvi faktor je klima tog područja. U toplijem području koje ima manje oborina, voda brže isparava kako se približava površini tla. Voda brzo isparava, ostavljajući minerale u zemlji. Sljedeći put kada padne kiša i voda se upije u zemlju, voda upija minerale i nosi ih u vodoopskrbu, dajući joj slan okus. Hladnije područje koje ima puno oborina imat će manji sadržaj minerala u vodi, poboljšavajući kvalitetu podzemne vode.
Drugi faktor koji kontrolira kvalitetu podzemne vode je dubina podzemne vode od površine. Dublji vodostaj će imati manje onečišćenja, jer je zagađivačima teže doći do vode. Međutim, dublja voda imat će veći sadržaj minerala. Voda radi na otapanju svega s čime dođe u dodir, pa kako tone dublje u zemlju, otapa minerale i nosi ih prema dovodu vode.
Zalihe plitke vode neće biti toliko mineralizirane, jer voda ne ide tako duboko. Međutim, ima višu razinu kalcija, željeza i magnezija jer tlo nema toliko vremena da ih ukloni. To čini vodu “tvrdom”. Plitka voda također ima veću vjerojatnost da će na njih utjecati kontaminacija.
Treći čimbenik koji kontrolira kvalitetu podzemnih voda je vrsta tla i sedimenta na tom području. Neke vrste sedimenta imaju kemikalije i minerale, poput sumpora, koji se brzo otapaju, uzrokujući veći sadržaj minerala u vodi. Ostale vrste sedimenta imaju manje sadržaja koji se lako mogu otopiti i odnijeti u vodoopskrbu.
Drugi aspekt kvalitete podzemne vode kontroliran tipom tla je propusnost tla. Pijesak, koji ima visoku propusnost, omogućuje vodi da se lako kreće kroz njega, sprječavajući vodu da pokupi puno minerala na svom putu. Manje propusno tlo, poput gline, usporava vodu, dajući joj priliku da otopi više minerala. Međutim, kada se voda polako kreće kroz tlo, postoji veća šansa da za sobom ostavi onečišćujuće tvari i druge zagađivače, stvarajući čišću opskrbu vodom.