Endometrij je sluznica koja se nalazi unutar maternice. Spriječava razvoj adhezija srednjeg sloja maternice, zvanog miometrij, i osigurava prostor za pričvršćivanje posteljice na maternicu tijekom trudnoće. Sastoji se od sloja epitelnih stanica spojenih s miometrijom vezivnim tkivom.
Debljina endometrija se mijenja zajedno s menstrualnim ciklusom žene. Zadeblja se tijekom folikularnog ciklusa. U tom se razdoblju maternica priprema prihvatiti mogući embrij. Ako se jaje oplodi i dođe do začeća, posteljica, koju stvara embrij, pričvrstit će se za stijenku endometrija. Ova veza osigurava transport kisika i hranjivih tvari od majke do embrija.
Tijekom većine mjeseci, jaje neće biti oplođeno. U ovim mjesecima, sluznica će se pokvariti i odlijepiti kroz proces menstruacije. Ciklus tada počinje iznova, jer se tijelo još jednom priprema za moguću trudnoću. Kada je embrij prisutan i implantira se u maternicu, endometrij se ne gubi, već postaje dio posteljice, pružajući potporu kao i hranjive tvari tijekom trudnoće.
Promjene u endometriju nastaju zbog različitih razina hormona. Zadebljanje unutarnjeg sloja maternice rezultat je povećanja razine estrogena. Nakon što jajovodi otpuste jaje, povećava se i razina progesterona. To zaustavlja nakupljanje stanica na stijenci maternice i priprema maternicu za moguću implantaciju embrija. U mjesecima kada nema embrija, razina progesterona će ponovno pasti, a višak sluznice se izlučuje kroz menstrualni ciklus.
Ponekad postoje komplikacije u razvoju endometrija. Niska razina hormona ponekad sprječava zadebljanje unutarnje stijenke maternice. Fizički rezultat toga je amenoreja, odnosno izostanak menstrualnog ciklusa. Najčešći je kod sportaša ili osoba s niskom razinom tjelesne masti. Prosječni ciklus za izgradnju i izlučivanje endometrija je 28 dana, ali to se može promijeniti kao reakcija na stres, godišnja doba i gubitak ili debljanje.