Koštani sustav je oslonac za tijelo. Štiti organe i osigurava sidrenje za ligamente, tetive i mišiće koji omogućuju kretanje. Iako i muški i ženski koštani sustav sadrže isti broj kostiju, među njima postoje razlike. Razlike između koštanog sustava muškaraca i žena su strukturalne i uključuju područja kao što su zdjelica, lubanja i udovi. Masa i razvoj kostiju dva su dodatna područja razlike u koštanom sustavu.
Jedno od područja razlike između muškog i ženskog koštanog sustava je zdjelica. Ženska zdjelična kost i zdjelična regija oblikovani su drugačije nego kod muškaraca, budući da je zdjelična regija žene napravljena da omogući proces porođaja. Ženske zdjelične regije su kružnije, a zdjelična kost je manja i šira. Muške zdjelične šupljine, nasuprot tome, nisu tako plitke.
Strukturne razlike između muškog i ženskog koštanog sustava također su očite u lubanji. Mali izbočeni dio koji se nalazi na stražnjoj strani lubanje, nazvan vanjska okcipitalna izbočina, vidljiviji je na muškoj lubanji nego na ženskoj lubanji. Čeljusne kosti ženske lubanje također su zaobljene, dok je muška čeljusna kost četvrtasta. Kosti obrva ženske lubanje nisu tako izražene kao kod muške lubanje. Ovi aspekti stvaraju razlikovne značajke koje stvaraju vizualne razlike u muškim i ženskim strukturama lica.
Kosti koje čine udove kostura također pokazuju razlike između koštanog sustava muškaraca i žena. Ulna, radijus i humerus su tri kosti koje čine ruke, dok su fibula, tibija i femur kosti noge. Kod muškaraca su ove kosti općenito duže i deblje nego u ženki. Kosti prstiju, zvane falange, također su obično veće kod muškaraca nego kod žena. Neki muškarci, međutim, imaju kraće kosti od žena.
Ukupna masa pridonosi razlici između muškog i ženskog koštanog sustava. Muški kosturi su često teži i puno veći. Iako masa kostura može biti opća referentna točka, ne može se koristiti sama. Postoje muškarci koji su manji od prosjeka i imat će manje kosture. Osim toga, postoje neke žene s većim kosturom od prosjeka. Kako bi se utvrdilo je li kostur muški ili ženski, moraju se uzeti u obzir i druge velike razlike, uz genetiku i etničku pripadnost.
Na razlike između muškog i ženskog koštanog sustava također utječe razvoj kostiju. Hormoni igraju veliku ulogu u rastu kostiju. Za muškarce, testosteron je hormon koji utječe na rast i oblik kostiju, dok se ženski hormon koji utječe na razvoj kostiju naziva estrogen. Tijekom puberteta, razina estrogena je mnogo veća za žene i razina testosterona za muškarce, zbog čega se ženske kosti prestaju razvijati do 18. godine, a rast muškaraca prestaje do 21. godine.