Glavna funkcija integumentarnog sustava je osigurati zaštitni omotač za tijelo. Ovaj sustav uključuje kožu i srodne strukture, kao što su kosa, znojne i lojne žlijezde, te nokti. Čini barijeru protiv visokih i niskih temperatura, štetnih kemikalija i sunčevog zračenja, kao i mikroorganizama. Osim toga, ima veliku ulogu u osjetilu dodira i pomaže u održavanju tjelesne temperature. Isto tako, integumentarni sustav važan je za proizvodnju vitamina D i igra malu ulogu u izlučivanju otpada.
Ovaj sustav je prva obrana tijela od ozljeda ili ozljeda. Koža štiti unutarnje organe i druge strukture od ozljeda uzrokovanih trenjem, poput ogrebotina ili posjekotina. Također štiti od mikroorganizama, poput bakterija. Kosa izolira tijelo, štiti ga od sunčeve svjetlosti i, između ostalog, štiti od iritacija u očima. Nokti sprječavaju ozljede vrhova prstiju na rukama i nogama.
Koža je također važna za održavanje unutarnje tjelesne temperature. Za isparavanje znoja s kože potrebna je toplina koja pomaže u hlađenju tijela. To može biti čak 2 galona (7.5 litara) ili više u ekstremnim uvjetima. Kada tjelesna temperatura poraste, protok krvi se također povećava do kože, gdje se višak topline gubi konvekcijom. U hladnijim sredinama dotok krvi u kožu se smanjuje, što smanjuje gubitak topline.
Pružanje informacija o okolišu organizma također je glavna funkcija integumentarnog sustava. Živčani završeci u koži omogućuju tijelu da osjeti promjene temperature, pritisak i dodir. Gornji sloj sadrži receptore odgovorne za osjet dodira, dok oni u donjem sloju kože mogu osjetiti toplinu i hladnoću, pritisak i bol. Folikuli dlake, ali ne i sama kosa, također reagiraju na dodir.
Pomaganje tijelu u stvaranju vitamina D važna je uloga kože. Dio procesa događa se kada ultraljubičasto svjetlo sunca udari u molekule prekursora u koži. Promijenjene molekule kasnije se u bubrezima i jetri pretvaraju u aktivni oblik vitamina D. Tijelo na taj način može proizvesti sav potreban vitamin D, pod uvjetom da je na raspolaganju dovoljno sunčeve svjetlosti.
Manja funkcija sustava je izlučivanje otpada. Znoj je gotovo sva voda, ali sadrži male količine otpadnih proizvoda, kao što su urea, mokraćna kiselina i amonijak. Drugi organi, kao što su bubrezi, igraju puno veću ulogu u oslobađanju tijela od otpadnih tvari.