Nuspojave proteina sirutke općenito se smatraju minimalnim, iako neke postoje. Mnogi od spojeva koji se nalaze u proteinu sirutke uobičajeni su u većini dijeta, iako visoka razina proteina može uzrokovati probavne nelagode, mučninu, probleme s bubrezima i druge bolesti kod nekih ljudi. Osim toga, alergijske reakcije mogu biti prisutne kod osoba koje ne podnose laktozu. Ljudi koji uzimaju određene lijekove i antibiotike također mogu biti upozoreni na uzimanje proteina sirutke.
Većinu vremena, nuspojave proteina sirutke nisu specifične za sam proizvod. Umjesto toga, takvi učinci ukazuju na količinu proteina, kalcija, ugljikohidrata, laktoze ili drugih spojeva i hranjivih tvari koje se nalaze u proizvodu. Drugim riječima, većina sastojaka koji uzrokuju nuspojave ili interakcije nalaze se u prosječnim dijetama.
Kao što samo ime govori, proizvod sadrži visoku razinu proteina. Višak proteina može stvoriti preveliki pritisak na bubrege. Također iscrpljuje tijelo određenim vitaminima i mineralima. Iz tog razloga, oni koji prakticiraju visokoproteinsku dijetu često uzimaju multivitaminske dodatke. Visokoproteinska dijeta, kakvu prakticiraju oni koji redovito konzumiraju proteine sirutke, također može povisiti kiselost krvi, koju treba držati što bliže neutralnoj (7.0 na pH ljestvici).
Oni koji ne vježbaju redovito možda nemaju razloga uzimati proteine sirutke, osobito u zapadnoj kulturi gdje su velike količine proteina uobičajene u prosječnoj prehrani. Nuspojave proteina sirutke mogu se izbjeći uzimanjem proizvoda samo kada pokušavate izgraditi mišićnu masu ili izgubiti težinu. Bilo koja od ovih prednosti ostvarit će se samo ako je popraćena tjelovježbom i općenito zdravom prehranom.
Neke nuspojave proteina sirutke proizlaze iz količine laktoze u proizvodu, koja je obično blizu 5 ili 6 posto. Opet, kao što ime sugerira, protein sirutke dolazi od spoja u mlijeku koji se zove whey, koji je odvojen od skute koja se koristi u proizvodnji sira. Primarni šećer koji se nalazi u mlijeku i sirutki je laktoza, na koju mnogi ljudi ne podnose. Netolerancija na laktozu može uzrokovati probavne tegobe i tegobe. Izolat proteina sirutke, koji sadrži manje od jedan posto laktoznog šećera, dostupan je onima koji pate od intolerancije na laktozu.
Nepravilno doziranje također može uzrokovati nuspojave proteina sirutke. Proizvod se općenito smatra sigurnim i korisnim ako se uzima u odgovarajućim količinama. Previše, međutim, može uzrokovati mučninu, pojačano pražnjenje crijeva, umor i gubitak apetita.
Postoje neke interakcije između proteina sirutke i određenih lijekova na recept ili antibiotika. Oni koji uzimaju tetracikline, na primjer, možda žele biti oprezni, jer visoka razina kalcija u proteinu sirutke može inhibirati apsorpciju tetraciklina u želucu. Ovaj se problem može riješiti izbjegavanjem konzumacije proteina sirutke i tetraciklina u razmaku od četiri sata. Liječnik će vjerojatno pružiti takve informacije, a mnoge robne marke pružit će opsežne indikacije, upozorenja i informacije o nutritivnoj vrijednosti uz svoje proizvode.