Za neke može biti iznenađenje da su određene vrste bakterija, poput onih koje se nalaze u jogurtu, zapravo korisne, a ne štetne. Različite vrste bakterija u jogurtu obično uključuju Lactobacillus bulgaricus, Streptococcus thermophilus i, u nekim slučajevima, Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus casei i bifidobakterije. Jogurt se jede toliko dugo da nitko zapravo nije siguran kako je nastala ideja o uvođenju bakterija u mlijeko kako bi se proizvela ova bogata, ljutkasta hrana. Ono što je sigurno, međutim, jest da bakterije u jogurtu obavljaju neke važne funkcije, od stvaranja jedinstvenog okusa i teksture jogurta do promicanja brojnih zdravstvenih prednosti kod potrošača.
Dokazi upućuju na to da se jogurt jede od najmanje 500 godina prije Krista, a vjeruje se da su dvije vrste bakterija bile uključene u proizvodnju jogurta od davnina. Te bakterije su Lactobacillus bulgaricus i Streptococcus thermophilus. Kada se dodaju mlijeku, te se bakterije počinju hraniti laktozom, šećerom koji se nalazi u mliječnim proizvodima, a zatim proizvode mliječnu kiselinu. Nije poznato kako su te bakterije u početku našle put u mlijeko, iako neki sumnjaju da se proces možda dogodio slučajno. Bez obzira na to, mliječna kiselina koju proizvode bakterije pokazala se vrlo korisnom za drevne narode, jer je omogućila da mliječni proizvodi ostanu svježi dulje nego inače.
Od ranih 2000-ih, mnogi proizvođači jogurta u SAD-u i Europi pokrenuli su reklamne kampanje privlačeći pozornost javnosti na bakterije u jogurtu. Bakterije koje se spominju u takvim kampanjama često su dopuna dvjema vrstama bakterija koje su se oduvijek nalazile u jogurtu. Ove dodatne bakterije mogu uključivati Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus casei i bifidobakterije. Zajedno, te se bakterije često nazivaju probioticima, što je izraz koji aludira na niz zdravstvenih dobrobiti za koje se vjeruje da promiču.
Doista, osim što stvaraju gustu teksturu i ugodan oštar okus, mnogi medicinski stručnjaci vjeruju da bakterije u jogurtu dobro djeluju na zdravlje na nekoliko načina. Prije svega, razgradnjom laktoze te bakterije obavljaju funkciju s kojom se bore osobe koje ne podnose laktozu. Zbog toga se jogurt netolerantni na laktozu često bolje podnose od ostalih mliječnih proizvoda, te stoga može biti važan izvor kalcija i proteina. Također se vjeruje da bakterije u jogurtu promiču zdravu ravnotežu bakterija u crijevima, zauzvrat poboljšavajući zdravlje probave. Konačno, bakterije mogu pomoći u sprječavanju gljivičnih infekcija kod žena.