Kornjače, gušteri, krokodili i zmije smatraju se gmazovima. Gmazovi svake od ovih vrsta mogu se naći na popisu ugroženih gmazova, što znači da postoji velika šansa da će izumrijeti. Različiti čimbenici koji mogu dovesti do izumiranja uključuju klimatske promjene, promjenu omjera grabežljivaca i plijena, gubitak staništa i ljudske aktivnosti. Gubitak staništa najčešći je uzrok ugroženosti vrste.
Nekoliko vrsta morskih kornjača su ugroženi gmazovi. Tu spadaju glavata, kožasta, jastrebov kljun i zelene morske kornjače. Više čimbenika uzrokovalo je da morske kornjače postanu ugrožene.
Morske kornjače mogu težiti i do 300 funti (136.08 kg). Polažu jaja na kopno gdje su ženke ranjive na grabežljivce jer ih njihova teška težina tjera da se kreću polako kada su izvan svog vodenog okoliša. Ljudski lovokradice još su jedna prijetnja ženki kornjače na kopnu.
Neke kulture jaja kornjača smatraju delikatesom. Ponegdje je popularna i juha od kornjača, pa se dijelovi živih morskih kornjača uklanjaju kako bi se napravila juha od kornjača. Ljudska naselja i rekreacijske aktivnosti smanjile su teritorij pogodan za ženke za polaganje jaja, što ponekad uzrokuje da ženka ili polaže jaja u okruženju neprikladnom za gniježđenje ili da u potpunosti pobaci.
Komodo zmaj je najveći gušter na svijetu i sposoban je doseći duljinu od 12 m. Njegov primarni uzrok ugroženosti je gubitak staništa zbog razvoja čovjeka. Ilegalni lov dodatno je desetkovao broj ovih ugroženih gmazova.
Sijamski krokodil nalazi se na popisu ugroženih gmazova. Gubitak staništa pridonio je smanjenju broja krokodila. Farmeri u Kambodži i Tajlandu isušili su veliki dio močvarnog terena krokodila kako bi povećali količinu poljoprivrednog zemljišta. Krokodilska koža je vrijedna, pa su ljudski krivolovci pomogli da se broj krokodila još više smanji. Vjeruje se da je globalno zatopljenje također pridonijelo smrti mnogih sijamskih krokodila.
Zmije koje su ugroženi gmazovi uključuju podvezicu iz San Francisca i istočni indigo. Povećani razvoj smanjio je stanište zmije podvezice iz San Francisca, a zagađenje je pomoglo smanjenju njezine brojnosti. Razvoj velikih količina zemlje u južnom dijelu Sjedinjenih Država glavni je razlog zašto se istočni indigo nalazi na popisu ugroženih gmazova.