Plaća morskog biologa može ovisiti o specijalnosti, lokaciji i poslodavcu, kao i o iskustvu i kvalifikacijama. Početne pozicije za osobe s niskim kvalifikacijama obično su manje plaćene, a ljestvica plaća raste kako ljudi stječu iskustvo i dodatne diplome ili certifikate. Karijera u ovom području može zahtijevati napredne diplome sa sedam ili više godina obrazovanja, što je značajno ulaganje, prije nego što ljudi počnu raditi. U nekim slučajevima moguće je zadržati početni položaj tijekom školovanja, iako može potrajati dulje za diplomiranje.
Jedan važan čimbenik je ono na što se morski biolog usredotočuje. Ako je tema nejasna, osobito u području čistog istraživanja, možda neće biti puno novca na raspolaganju, a plaća morskog biologa može biti relativno niska. Nasuprot tome, teme od interesa, posebno stvari koje utječu na industrije temeljene na morskim organizmima, mogu se dobro isplatiti. Netko tko se usredotočuje na ribarstvo, na primjer, može zaraditi više od osobe koja proučava nejasnu ribu bez komercijalne vrijednosti.
Lokacija također igra ulogu u plaći morskog biologa. Platne ljestvice mogu varirati ovisno o državi i ono što se može smatrati dobrom ili prihvatljivom plaćom na jednom mjestu nije na drugom. Razlike u troškovima života, socijalnim uslugama dostupnim stanovnicima i drugim čimbenicima mogu utjecati na to koliko je poslodavac spreman ponuditi. Ljudi koji rade na međunarodnoj razini možda će htjeti razmotriti ovo pitanje; rad u inozemstvu mogao bi pružiti zanimljive prilike, ali možda neće biti tako dobro plaćen.
Izbor poslodavca je još jedan ključni utjecaj na plaću morskog biologa. Privatne institucije, posebno one koje se bave industrijom, obično plaćaju više. Državne agencije mogu ponuditi manje plaće i ponekad zahtijevati od morskih biologa da napišu potpore za potporu njihovom radu, što može pojesti dragocjeno vrijeme istraživanja. U akademskim institucijama, plaća morskog biologa može varirati ovisno o iskustvu i ugledu. Ljudi zainteresirani za nastavak karijere u akademskim krugovima trebali bi dobiti kredite za objavljivanje kako bi poboljšali svoju poziciju u pregovorima o plaćama.
Preporuke, iskustvo i reputacija također su od ključne važnosti. Netko s naprednom diplomom, članstvom u prestižnim organizacijama i formalnim priznanjima zasluga može imati pravo na veću plaću, kao i netko s više iskustva u zajednici morske biologije. Ljudi koji se smatraju uglednim i pouzdanim istraživačima također su obično bolje plaćeni. Ostali morski biolozi imaju visoke plaće jer su popularizirali ovo područje kroz knjige, filmove i druge medije, a time i prepoznatljivost u kućanstvu, zbog čega su institucije željne da ih angažiraju i spremne platiti za tu privilegiju.