Dodatni troškovi su dodatne naknade koje naplaćuje brodarska tvrtka za usluge koje ne spadaju u rutinsko preuzimanje i dostavu paketa i pošiljaka. Takve se naknade obično procjenjuju u obliku paušalne naknade, a većina tvrtki objavljuje rasporede dodatnih naknada kako bi kupce upoznali s vrstama naknada kojima mogu biti podvrgnuti u vezi s pošiljkom. Ovi troškovi mogu varirati među brodarskim tvrtkama, a kupci s velikim ili čestim narudžbama možda će htjeti kupovati kako bi utvrdili gdje je najbolja ponuda.
Pošiljatelji mogu procijeniti dodatne troškove za posebno rukovanje kao što su gotovina pouzećem, preuzimanje treće strane, osiguranje i tako dalje. Gorivo, vrijeme čekanja i dostava u zatvorenom prostoru također mogu biti podložni dodatnim troškovima. Ovi se troškovi mogu temeljiti na naknadi po pošiljci ili se mogu procijeniti prema težini i veličini, ovisno o vrsti usluge koja se pruža. Pošiljke se također mogu naplatiti ako idu izvan rutinske rute dostave, kao u slučaju dodatnih naknada za ruralne rute koje koriste neke brodarske tvrtke u Sjedinjenim Državama. Vozači i drugi rukovatelji vode brižljivu evidenciju o svemu što bi moglo biti podložno dodatnim naknadama u korist svojih poslodavaca.
U trenutku slanja narudžbe za otpremu, predstavnik brodarske tvrtke trebao bi utvrditi primjenjuju li se posebne naknade. Za vrlo osnovno preuzimanje i dostavu ne naplaćuju se dodatne naknade; klijentu će biti naplaćena cijena koja odgovara brzini i vrsti dostave. Čim klijenti počnu tražiti dodatne usluge, pošiljatelj može početi dodavati dodatne troškove.
Također su mogući dodatni troškovi zbog nečega što se događa tijekom otpreme. Na primjer, brodarske tvrtke mogu dodatno naplatiti ako trebaju ponovno dostaviti jer netko nije prisutan da bi potpisao pošiljku ili zbog drugog problema kao što je zaključana vrata. Isto tako, pošiljatelji mogu naplatiti ako primatelj zatraži posebnu uslugu, kao što je dostava paleta u zatvorenom prostoru predviđena za redoviti isporuku.
Trošak pošiljke može se značajno povećati kada se dodaju dodatni troškovi. Poduzeća koja isporučuju kupcima možda će to morati razmotriti i strukturirati takve troškove u procjene otpreme na temelju dostupnih informacija o pošiljci. Ako to ne učine, mogli bi snositi gubitak na troškovima dostave ili bi mogli biti prisiljeni kontaktirati klijenta kako bi izvršili izmjene narudžbe.