Alternativni sustavi trgovanja su sustavi koji se koriste za trgovanje vrijednosnim papirima. Odobrene su od strane Komisije za vrijednosne papire i burze, ali djeluju izvan tradicionalnih burzi. Prema Uredbi Komisije za vrijednosne papire ATS, alternativni sustav trgovanja je „svaka organizacija, udruga, osoba, grupa osoba ili sustav koji čini, održava ili pruža tržište ili objekte za okupljanje kupaca i prodavača vrijednosnih papira ili za inače u odnosu na vrijednosne papire obavlja funkcije koje obično obavlja burza.”
Elektronička komunikacijska mreža (ECN) je alternativni sustav trgovanja dionicama i valutama. ECN se koristi za aktivno trgovanje, pri čemu sustav trgovanja odgovara nalozima za kupnju i prodaju. Prikazuju se narudžbe koje nije moguće uskladiti kako bi zainteresirane strane mogle podnijeti odgovarajuće narudžbe. Pojedinci ili brokeri mogu se pretplatiti na elektroničku komunikacijsku mrežu. Instinet je prva i najveća elektronička komunikacijska mreža.
Alternativni sustavi trgovanja korisni su za međutržišno trgovanje jer se dionicama kotiranim na drugoj burzi, kao što je New York Stock Exchange (NYSE) ili Nasdaq, može trgovati putem elektroničkih komunikacijskih mreža. Troškovi povezani s trgovanjem na alternativnom sustavu trgovanja obično su niži, budući da se trgovine izvršavaju elektronički. Više ljudi može pristupiti tržištu putem alternativnih sustava trgovanja nego putem centraliziranog tržišta kao što je NYSE. To znači da će cijene vrijednosnih papira kojima se trguje u alternativnim sustavima trgovanja, teoretski, biti reprezentativnije za njihovu pravu vrijednost, jer sile ponude i potražnje slobodnog tržišta djeluju nesputano.
Ako institucionalni investitor želi kupiti ili prodati veliku količinu određenog vrijednosnog papira, korištenje mreže križanja, vrste alternativnog sustava trgovanja, može biti poželjnije od obavljanja transakcije na tradicionalnoj burzi. Kupnja ili prodaja velikog paketa dionica na tradicionalnoj burzi često može pomaknuti cijenu tog vrijednosnog papira. Trgovanje na mreži za ukrštanje, koja odgovara nalozima bez njihovog usmjeravanja kroz burzovnu ili elektroničku komunikacijsku mrežu, to neće učiniti, jer se nalozi za kupnju i prodaju uparuju i izvršavaju anonimno. Ovi alternativni sustavi trgovanja nemaju obilježje podizanja ili smanjenja cijene, kao što to čine centralizirana tržišta.
Druga vrsta alternativnog sustava trgovanja je tržište poziva. Na tržištu poziva mnoge su narudžbe grupirane zajedno. Nakon što nalozi dosegnu određeni volumen, grupa naloga se izvršava istovremeno. To povećava učinkovitost i smanjuje troškove.