Računovodstvo fondova je vrsta računovodstvene strategije koja se više usredotočuje na odgovornost nego na praćenje generiranja dobiti. Ovaj poseban pristup računovodstvu često koriste subjekti koji nisu usredotočeni na profitabilnost, kao što su neprofitne organizacije ili vladini odjeli i komisije. Jedna od glavnih značajki ove metode je korištenje više glavnih knjiga koje dokumentiraju tijek i korištenje svih sredstava koja dolaze u subjekt, ali bez naglaska na praćenju dobiti.
Opća funkcija računovodstva fondova ima veze s pokazivanjem gdje se novac troši. Ovaj je naglasak jedan od razloga za vođenje nekoliko glavnih knjiga, a ne samobalansirajućih računa prikazanih u jednoj glavnoj knjizi, kao što je uobičajeno kod subjekata koji posluju radi profita. Svaka od knjiga prati primitak i isplatu sredstava jer se odnose na aktivnosti povezane s određenim projektom ili fondom kojim upravlja neprofitni subjekt. Za potrebe računovodstva, svaka pojedinačna knjiga ili fond mora biti usklađen unutar sebe, zajedno s detaljnim izvješćima koji podržavaju trenutni saldo u fondu. Sva izvješća povezana s različitim fondovima koriste se kao prateći detalj za kumulativno izvješće koje se stavlja na raspolaganje članovima organizacije, kao i njezinim direktorima.
Uz računovodstvo fondova, sve donacije ili sredstva dobivena od bespovratnih sredstava ili zadužbina knjiže se izravno u knjigu ili fond koji je odredio suradnik. Tamo se svi izdaci povezani s tim konkretnim projektom odbijaju od bilance. Ovaj aranžman vrlo olakšava neprofitnoj organizaciji prijavljivanje aktivnosti svojim članovima, kao i svim državnim subjektima koji su zaduženi za nadzor nad radom neprofitne organizacije.
Pristup računovodstva fondova može biti vrlo učinkovit kada se izvješća moraju slati više od jedne vladine agencije. Na primjer, ako lokalno upravljana dobrotvorna organizacija primi bespovratnu pomoć namijenjenu osiguravanju obroka zatvorenicima, velikodušnu donaciju za podršku skloništu za beskućnike i donaciju za rad programa nakon škole, svaki od ovih projekata će vjerojatno propasti u nadležnost druge vladine agencije. Izradom i održavanjem knjige za svaki projekt, moguće je svakoj nadzornoj agenciji uvijek dati računovodstvo o tome što je učinjeno s novcem primljenim za podršku svakom programu. Korištenjem računovodstva fondova, lokalna dobrotvorna organizacija ostaje u skladu s propisima koji joj dopuštaju rad i može dokazati da se primljena sredstva koriste na propisani način.