Dagnje se mogu kuhati na mnogo različitih načina, ali najčešća metoda je kuhanje na pari – bilo kao pojedinačna metoda ili se koristi za njihovo prethodno kuhanje prije upotrebe druge metode kuhanja. Sjajni, crni školjkaši ovalnog oblika otvaraju se tijekom procesa parenja. Osim što se kuhaju na pari, dagnje se često prže, peku na roštilju i peku.
Bez obzira na to koju metodu kuhanja koristite, uvijek kupujte dagnje iz pouzdanog izvora u nekontaminiranom području. Zanimljivo je da su oni s mesom više na bijeloj strani obično ženke, a mekušci s mesom koje je više narančaste boje često su mužjaci. Oba su u osnovi ista, okusom, s tim da je sok oba najukusniji dio. Dagnje je potrebno nekoliko puta isprati kako bi se uklonio pijesak prije kuhanja na pari i izvaditi izbočinu “brade”.
Dagnje kuhane na pari mogu se napraviti dodavanjem pripremljenih mekušaca u nekoliko šalica tekućine dovedene do kuhanja na pari u velikom loncu ili nizozemskoj pećnici. Nakon što se dodaju dagnje, treba ih kuhati na pari oko osam minuta na srednjoj vatri. Ako je moguće, treba ih pažljivo okrenuti nakon četiri-pet minuta kuhanja. Dagnje se nikada ne smiju prekuhati jer mogu postati žilave. Nakon što se školjke otvore parom, gotove su i ne smiju se koristiti sve s neotvorenim školjkama.
Dagnje se mogu premazati finim krušnim mrvicama i pržiti u tavi ili čak pržiti u dubokom ulju. Mogu se ispeći i u pećnici na poluljusci i posuti maslinovim uljem i začinskim biljem. Dagnje treba samo oko pet minuta na vanjskom roštilju na srednjoj do jakoj vatri. Ukusni su u juhama, ali ih je najbolje dodati pred kraj kuhanja kako bi se izbjeglo prekuhanje.
Ovi mekušci mogu biti zamjena za školjke u jelima kao što je linguine s umakom od školjki, a neki recepti zahtijevaju i jedno i drugo. Salate u meksičkom stilu ponekad koriste dagnje i one daju osebujan izgled španjolskom jelu paelli. Kuhinja jugoistočne Azije često koristi kokos i đumbir u jelima od dagnji. Klasično francusko jelo, moules mariniers, s njima miješa maslac, vino, luk, sol, papar i peršin. Za upijanje soka koristi se baguette.
Za začinjavanje kuhanih dagnji može se koristiti mnogo različitih vrsta umaka. Francuski roux može poslužiti kao temeljac za umak, kao i teriyaki ili umak od rajčice. Opća smjernica koja se obično koristi pri kupnji je da dopustite 1 lb (450 g) u ljusci po osobi za glavno jelo i 0.5 lb (225 g) po osobi za prilog ili predjelo.