Najbolji prirodni grčki jogurt je onaj koji je gust, kremast i bez aditiva i konzervansa. Autentičan prirodni grčki jogurt ne sadrži nikakve zgušnjivače kao što su želatina ili kukuruzni škrob, ali je prirodno gust zbog procesa cijeđenja tekuće sirutke. To koncentrira i povećava proteine u kutiji jogurta, ali malo smanjuje kalcij. Najbolji prirodni grčki jogurt može biti skuplji od ostalih vrsta jer je za izradu potrebno tri puta više mlijeka.
Grčki jogurt je bogat hranjivim tvarima i prijateljskim bakterijama. I obični i prirodni grčki jogurt nastaju dodavanjem kultura živih bakterija, Streptococcus thermophilus i Lactobacillus bulgaricus, u mlijeko kako bi se fermentiralo. Tekuća sirutka se zatim uklanja iz grčkog jogurta kako bi se zgusnula konzistencija. Usporedba kartona običnog jogurta s kutijom prirodnog grčkog jogurta pokazuje da grčki jogurt ima više kalorija i znatno više proteina, ali manje kalcija u odnosu na obični jogurt.
Jogurti s dugačkim popisom sastojaka su oni kojima su dodana punila kao što su zgušnjivači, zaslađivači te umjetne arome i boje. Ovi sastojci smanjuju dobrotu i povećavaju broj kalorija, pa je najbolji jogurt za kupiti onaj s najmanje sastojaka. U slučaju prirodnog grčkog jogurta, to bi trebali biti mliječno vrhnje, jogurtna kultura i kravlje ili ovčje mlijeko. Na kutiji treba biti naljepnica koja označava da je kultura jogurta živa i aktivna.
Probiotici ili žive kulture prisutni su u svim prirodnim grčkim jogurtima. Oni potiču staničnu imunost, bolje zdravlje crijeva i povećavaju dobar kolesterol. Iako se svi jogurti izrađuju pomoću bakterijskih kultura, nemaju svi istu količinu. Oznaka “živa kultura” na kutiji znači da jogurt sadrži značajnu količinu kulture po gramu proizvoda. Neke tvrtke dodaju dodatne probiotike i kulture kako bi promovirale jogurt kao još korisniji za imunitet i zdravlje probave. Neki jogurti se termički obrađuju nakon fermentacije i to će ubiti većinu korisnih bakterija.
Prirodni jogurt bez dodanih sastojaka koji nije termički obrađen i nosi oznaku “živa kultura” uvijek će biti najzdravija opcija. Osim toga, to je jednostavno slučaj ukusa. Neki ljudi koji su navikli na zaslađene proizvode mogu smatrati da je okus prirodnog grčkog jogurta pomalo oštar ili kiselkast, ali kremastost i tekstura za većinu su odgovarajuća kompenzacija.