Uvođenje kokica u mikrovalnoj pećnici tijekom 1980-ih činilo se kao prirodan napredak nakon uspjeha kokica na štednjaku i kokica na zraku. Potrošač bi presavijenu vrećicu s uljem, aromom i zrnom kokica stavio u mikrovalnu pećnicu na nekoliko minuta. Rezultati su mogli biti promjenjivi, od poluotvorene vrećice do vrećice za pušenje ugljika, ali općenito su kokice iz mikrovalne pećnice bile slične drugim oblicima kokica, a gotove su za mnogo kraće vrijeme.
Pitanja o sigurnosti kokica u mikrovalnoj pećnici počela su se javljati kada su brojni radnici tvornice kokica počeli prijavljivati ozbiljne respiratorne probleme tijekom rada s kemikalijama koje se koriste za obradu kokica. Točnije, kemikalija poznata kao diacetil bila je sumnja na iritaciju. Diacetil se koristi za stvaranje okusa maslaca u raznim začinima i prerađenoj hrani, uključujući umjetni okus maslaca koji se koristi za kokice u mikrovalnoj pećnici. Male količine diacetila ne smatraju se toksičnim, ali kada se zagriju u tvorničkoj skali, isparenja mogu izazvati respiratorno stanje poznato kao pluća kokica.
Kada je vijest o izloženosti kokičara dijacetilu postala javna, mnogi zdravstveni djelatnici postali su zabrinuti zbog sigurnosti kokica u mikrovalnoj pećnici na razini potrošača. FDA i druge agencije utvrdile su da količina diacetila sadržana u prosječnoj vrećici nije dosegla toksične razine, iako su kritičari doveli u pitanje valjanost ovih nalaza nakon što su otkrili da je malo ili nikakvo testiranje zapravo provedeno na razini potrošača. Gotovo svi prijavljeni slučajevi plućnih kokica dogodili su se kod radnika tvornice kokica, ali jedan potrošač koji je pojeo dvije vrećice kokica svaki dan i uobičajeno je osjetio njihov miris dobio je blaži oblik bolesti.
Ako uopće postoji bilo kakva opasnost povezana s kokicama iz mikrovalne pećnice, najprisutnija je kada se vrećica prvi put otvori i zagrijani dimovi izađu. Udisanje ovih para izložit će potrošača najvišoj mogućoj razini diacetila na razini potrošača. To može uzrokovati oštećenje najmanjih zračnih prolaza u plućima potrošača ili izazvati već postojeći napad astme. Mala djeca i oni s ugroženim kapacitetom pluća također mogu imati štetnu reakciju nakon udisanja prvih para vruće vrećice kokica iz mikrovalne pećnice.
Ostali sastojci sadržani u kokicama za mikrovalnu pećnicu ne smatraju se toksičnim, iako bi neki zdravstveni stručnjaci upozorili na konzumaciju visokih razina natrija ili djelomično hidrogeniranih ulja. Općenito koristi zdravija ulja koja se poslužuju u kinima ili na prodajnim štandovima. Izbjegavanje dodavanja umjetnog maslaca ili dodatne soli uvijek je dobra ideja za zdraviji međuobrok.