Postoji vrlo malo opasnosti od držanja štakora kućnih ljubimaca, ali samo ako se ti štakori pripitome i drže u kavezima. Štakori koji su ikada bili divlji mogu nositi brojne bolesti koje se mogu prenijeti na ljude. Kada životinje nikada nisu živjele u divljini, opasnosti od dobivanja bolesti od njih su gotovo iskorijenjene. Čak i tako, ljudi ne bi trebali rukovati glodavcima koji mogu imati bolest ako postoji bilo kakav rizik od prijenosa.
Dok štakori mogu nositi mnoge različite bolesti, oni koji se drže kao kućni ljubimci vrlo rijetko ih mogu uhvatiti. Bolesti se mogu širiti ugrizima i ogrebotinama te povremeno kontaktom s kožom. Moguće je da štakor nosi bolest koja je opasna za ljude bez ikakvih simptoma, što otežava procjenu je li životinja sigurna za rukovanje. Najbolji način da vlasnik kućnog ljubimca izbjegne da se razboli je da njegovi štakori budu zdravi i čisti.
Štakori koji slobodno trče u kući puno su opasniji od onih koji se drže u kavezima. Bolesti se mogu prenositi mokraćom i izmetom štakora, koje štakori često ispuštaju gdje god hodaju. Također, budući da štakori mogu dobiti mokraću i izmet na noge, moguće je da se osoba razboli od rukovanja jednom i dodirivanja lica ili hrane bez pranja ruku.
Osim bolesti, opasnosti od držanja štakora su slične onima od držanja drugih kućnih ljubimaca. Štakori mogu ugristi ili ogrebati, a mogu biti agresivni ako se njima rukuje ili ih se nepravilno odgaja. Većina ih je relativno mala, što znači da je sposobnost štakora da ozlijedi čovjeka vjerojatno manja od sposobnosti psa. Čak i u tom slučaju, ugrizi mogu biti bolni i mogu se ozbiljno zaraziti, pa nije dobra ideja dirati ili rukovati štakora osim ako im nije poznat.
Većina zabrinutosti oko opasnosti držanja štakora kao kućnih ljubimaca odnosi se na povijest širenja bolesti divljih štakora, a ne na pripitomljene štakore. Ne samo da je malo vjerojatno da će pripitomljeni prenijeti bolesti, već bi ih njihova prehrana i prirodno ponašanje čak mogli učiniti sigurnijima od životinja poput mačaka i pasa. Čak i tako, štakora koji izgleda bolesno ili koji je bio u divljini bilo koje vremensko razdoblje trebao bi pregledati veterinar. Kada šire bolesti, te bolesti imaju tendenciju biti ozbiljne i nije ih uvijek lako dijagnosticirati jer su često rijetke.