Endofit je organizam koji živi u biljci; izraz doslovno znači “unutarnja biljka”. Neki su parazitske prirode, iskorištavajući biljku kao opskrbu hranjivim tvarima ili energijom, dok drugi stvaraju uzajamni odnos sa svojim domaćinima, obavljajući funkciju koja daje dobrobit biljci domaćinu. Na primjer, endofit može izlučivati kemijske spojeve koji odvraćaju druge biljke, eliminirajući natjecanje u resursima za biljku domaćina.
Praksa endosimbioze, kao što je poznato, relativno je uobičajena u svijetu prirode, a čini se i iznimno drevnom. Manji organizmi žive unutar većih u različitim okruženjima, od dubina oceana do stijena na najvišim planinama. Vrlo dobro poznat primjer endosimbioze je lišaj. Lišaj je zapravo spoj dva različita organizma: gljive i endosimbiota kao što su alge ili cijanobakterija.
U slučaju endofita, najpoznatiji primjer je vjerojatno vlasulja. Neke vlasulje koloniziraju gljive koje trave čine jačom, izdržljivijom i sposobnom odoljeti teškim klimatskim uvjetima. I ne samo to, već stoka preferira vlasulje s endofitom, što sugerira da gljiva daje dodatnu nutritivnu vrijednost ili okus što koloniziranu travu čini privlačnom za životinje. Provedene su brojne studije kako bi se ispitalo kako raste vijuk koloniziran gljivama te kako bi se utvrdila razlika između koloniziranog i nezaraženog vijuka.
Istraživači su uvijek zainteresirani za identificiranje novih endofita i učenje o njihovim učincima na biljke u kojima žive. U slučaju uzajamnih odnosa, endofiti mogu biti vrlo vrijedan alat za preživljavanje za biljke kolonizirane s njima, budući da organizam na neki način koristi biljci kroz kolonizaciju. Vrsta koja djeluje kao endofit može se kretati kroz biljnu populaciju na različite načine, ovisno o biljci i dotičnom organizmu.
Bakterije i gljive su najčešći endofiti. Obje su dovoljno male da udobno žive u biljci domaćinu, a obje su također poznate po svojoj prilagodljivosti i spremnosti da iskoriste situacije koje mogu biti korisne. Gljive i bakterije također mogu proizvesti niz izlučevina koje mogu uključivati toksine kao i korisne spojeve. Uspostavljanje uzajamnog odnosa korisno je za obje vrste, povećavajući njihove šanse za dugoročni opstanak osiguravajući da i endofit i kolonizirana biljka mogu preživjeti u različitim okruženjima.