Briga za bonsai čempresa može ovisiti o određenoj vrsti stabla koja je odabrana, jer postoji više od 100 različitih sojeva čempresa dostupnih za obuku kao bonsai. Popularne verzije bonsaija čempresa uključuju Lawson — Chamaecyparis lawsoniana, japanski Hinoki — Chamaecyparis obtuse i japansku Sawaru — Chamaecyparis pisifera. Još jedna uobičajena vrsta bonsaija čempresa koja se preporučuje početnicima, iako nije prava vrsta čempresa, je ćelavi ili močvarni čempres – Taxodium distichum. Briga za čemprese stoga može varirati, jer neki preferiraju suhe klimatske uvjete poput japanskog Hinokija, a neki su porijeklom iz močvarnih područja i preferiraju stalno vlažno okruženje poput ćelavog čempresa. Općenito je pravilo, međutim, stabla čempresa je lako uzgajati kao bonsai, pa su od 2011. postali vrlo popularan izbor, a stabla su koja preferiraju punu sunčevu svjetlost i redovitu gnojidbu.
Većina vrsta čempresa je relativno izdržljiva, pa su dobri primjerci bonsaija, jer prilagođavanje stabla bonsai stilu života može biti stresan proces za stablo. Što se tiče učestalosti zalijevanja, čempres Hinoki je vrsta koja zahtijeva najsušnije uvjete. Tlo za Hinoki bi trebalo biti vlažno većinu vremena, ali to je vrsta otporna na sušu koja može preživjeti hladnije i sušnije uvjete od ostalih bonsaija čempresa. Duž ovog spektra, čempres Sawara zahtijeva više vode, budući da je porijeklom iz vlažnih područja, a ćelavi čempres zahtijeva gotovo konstantno stanje vlažnog tla budući da je porijeklom iz močvara. Stabla saware i ćelavog čempresa također mogu umrijeti ako su izložena hladnim uvjetima i moraju se prezimiti u staklenicima.
Bonsai općenito mogu biti skloni češćim napadima štetnika i bolesti nego njihovi kolege u divljini zbog ograničenih uvjeta u kojima se uzgajaju. Dok je stablo Hinoki prilično otporno na štetočine i bolesti, čemprese Sawara i Ćelav čempres često napadaju korijenske lisne uši i imaju osjetljive grane koje treba orezati prstima umjesto rezanja kako bi se spriječila nepotrebna šteta na stablima. Lawson čempres, koji je jedan od najpopularnijih sojeva bonsaija čempresa koji se uzgaja, također zahtijeva stalno vlažno tlo poput Saware, ali ne i uvjete preplavljene vodom u kojima ćelavi čempres obično uživa. Jedan od uvjeta uzgoja koji je zajednički za sve popularne bonsaije čempresa je da svi preferiraju punu sunčevu svjetlost, što često znači da je same posude za bonsai najbolje održavati na otvorenom.
Ćelavi čempres je dobio ime po tome što je jedinstveno listopadno stablo četinjača koje zimi gubi lišće nalik na iglice. Lišće će prvo postati narančasto, a zatim smeđe, što bi kod drugih čempresa bonsaija značilo da stablo umire. Kod Ćelavog čempresa ovo je prirodni jesenski događaj. Određivanje odgovarajuće razine vode za ćelavi čempres također se može obaviti promatranjem učinaka klonulosti na novom lišću, što ukazuje da mu treba više vode.
Sadnju bonsaija čempresa također se preporučuje ponavljanje svake dvije do tri godine za sve vrste, iako neke rastu brže od drugih. Hinoki ima tendenciju da raste najsporije, pa se može rjeđe presađivati od sorti poput Saware. Ćelavi čempres raste najbrže i može se sigurno presaditi svake godine. Budući da kora bonsaija čempresa može biti osjetljiva, potrebno je paziti i na ožičenje stabala kako bi narasla u određene oblike. Kako se žica zateže, treba ju ukloniti i zamijeniti labavijim namotima ili ih uopće nema.