Vakuum filtera za čestice zraka visoke učinkovitosti (HEPA) sadrži sustav filtracije koji dosljedno uklanja i najmanje čestice u zraku bez stvaranja bilo kakve vrste nusproizvoda iz procesa. Na tržištu postoje tri vrste filtracijskih usisavača: istinski ili zatvoreni HEPA usisavači, nebrtvljeni HEPA usisavači i HEPA usisavači. Certificirani, istiniti ili zapečaćeni HEPA usisavač ima zatvoreni sustav filtracije i često se preporučuje osobama s respiratornim problemima. Modeli koji se prodaju kao HEPA usisavači, ali čiji je sustav filtracije otvoren, imaju autentičan HEPA filter iako zarobljene čestice mogu pobjeći. Usisavači označeni kao HEPA-like mogu imati filter sličan HEPA-u, ali ne ispunjava zahtjeve za certificiranje kao pravi HEPA usisivač.
Svi pravi HEPA usisavači moraju uhvatiti 99.7% do 99.9% čestica zraka veličine samo 0.3 mikrona; HEPA certifikat bit će naveden na naljepnici usisavača. U Europi se usisavač s HEPA certifikatom naziva HEPA 13 ili 14 stupnja. Certificirani, zatvoreni HEPA usisavač dizajniran je tako da sav zrak koji ulazi u usisivač mora proći kroz sustav filtracije prije nego što izađe iz stroja. Sve čestice zraka zarobljene ovim tipom usisavača ostaju unutar usisavača sve dok se filter ne očisti ili isprazni. Zbog toga liječnici često preporučuju zatvorene HEPA usisavače pacijentima s astmom, alergijama i drugim respiratornim zdravstvenim stanjima.
Zatvoreni HEPA usisavači mogu koristiti jedan ili više filtara. Kako bi vakuum radio ispravno, filtar treba ukloniti barem jednom godišnje. Neki se filteri mogu prati, a drugi su jednokratni. Filtri za višekratnu upotrebu su u početku skuplji, ali mogu dugoročno uštedjeti novac kupcu.
Neki usisivači koriste prave, certificirane HEPA filtere, ali nemaju zatvoreni sustav filtracije. To znači da vakuum može pokupiti 99.7% do 99.9% čestica zraka veličine samo 0.3 mikrona, ali neke od tih čestica mogu završiti natrag u okolišu. To je zbog činjenice da sav zrak nije prisiljen proći kroz filter prije izlaska iz vakuuma. Sustav ne propušta i zrak može izaći iz bilo koje pukotine kada uđe u vakuum.
Postoje i usisavači nalik HEPA s naljepnicama za koje se tvrdi da hvataju 85% ili 90% čestica u zraku veličine samo 0.1 mikrona. Ovi usisavači mogu izgledati prilično slični originalnom certificiranom HEPA usisivaču, ali filteri u tim strojevima nisu prošli isto rigorozno testiranje. Veličina čestica od 0.1 mikrona koju ovi HEPA-usisavači pokupe nije tako mala od onoga što certificirani, zatvoreni HEPA usisavač može ukloniti. To znači da potrošač možda neće moći ukloniti grinje i pelud iz kućanstva, zbog čega ovaj stroj možda nije najbolji izbor za nekoga s alergijama ili drugim, sličnim stanjima.