Cvjetovi krastavca su mali i žuti s pet naboranih latica po cvijetu. Nalaze se na lozima biljke krastavac. Cvjetovi rastu ispod velikih zelenih listova koji pružaju hlad i zaštitu od okoliša. Većina biljaka proizvodi muške i ženske cvjetove, iako neke genetski modificirane biljke krastavca proizvode samo ženske cvjetove.
Biljka krastavca proizvodi muške cvjetove prije nego što izrastu ženski cvjetovi. Biljka koja uzgaja i muške i ženske cvjetove naziva se jednodomna. Nezrele loze krastavca stvaraju manje cvjetove od starijih biljaka. Krastavci uzgojeni iz cvjetova koji se prvi pojavljuju na novoj lozi često su nepravilnog oblika i sadrže manje sjemenki.
Ženski cvjetovi krastavca rastu pojedinačno na dugoj debeloj stabljici. Ispod latica na svakom cvijetu nalazi se lukovičasti jajnik. Plod krastavca nalazi se u malom na stabljici iza nezrelog ženskog cvijeta. Nakon što cvijet oprašuju kukci ili pčele, plod krastavca počinje rasti. Neadekvatno oprašene biljke će proizvesti krastavce koji su zeleni i deformisani.
Muški cvjetovi su vrlo svijetlo žuti i rastu blizu stabljike vinove loze. Stabljika muškog cvijeta mnogo je tanja i kraća od stabljike ženskog cvijeta. Unutar cvijeta su vidljiva tri prašnika. Mnogi muški cvjetovi rastu u grozdovima na lozi krastavca.
Muški cvijet krastavca počinje se otvarati gotovo deset dana ranije od ženskog cvjetnog pupa. Za svaki ženski cvijet koji cvjeta na biljci krastavca bit će prisutno deset do dvadeset muških cvjetova. Nekoliko unutarnjih sorti krastavaca zahtijevaju uklanjanje muških cvjetova kako bi se spriječila oplodnja ženskog cvijeta. Ako dođe do oplodnje, zreli plodovi krastavca će imati vrlo gorak okus.
Prilikom vrtlarstva, osoba mora paziti da ne poremeti ili ošteti nježne žute cvjetove krastavca. Jednom kada dođe do oštećenja, loza krastavca se može postaviti na rešetke kako bi se zaštitila do sljedeće vegetacijske sezone. Ako cvjetovi krastavca padaju s vinove loze prije nego što daju plodove, možda postoji problem oprašivanja. Ručno oprašivanje ženskih cvjetova zrncima peludi s muških cvjetova može pomoći u izbjegavanju daljnjeg gubitka ženskih cvjetova.
Za velike usjeve krastavaca, pčele se mogu uvoziti radi oprašivanja cvijeća. Standardni broj pčela potrebnih za pravilno oprašivanje cvjetova krastavca je jedna pčela na svakih 100 cvjetova. Neki poljoprivrednici odlučuju odgoditi oprašivanje dok loze ne sazriju duže; to omogućuje vrijeme za rast većih ženskih cvjetova, što rezultira boljim okusom plodova krastavca nakon berbe.