Možete ponovno instalirati Microsoft® Windows™ na jedan od dva načina: novu instalaciju ili instalaciju preko prethodne verzije. Nova instalacija ne zadržava prethodne postavke, instalirane programe ili podatke. Sustav se mora obnoviti od nule. Ako ponovno instalirate Microsoft® Windows™ preko prethodne instalacije, postavke i programi se zadržavaju. Ponekad će situacija zahtijevati jednu vrstu instalacije umjesto druge.
Postoje okolnosti koje zahtijevaju novu instalaciju, kao što je kada se sustav zarazi rootkitom. Rootkiti mogu infiltrirati operativni sustav na takav način da uklanjanje bude problematično, ako ne i nemoguće. Jedini način da budete sigurni u iskorijenjivanje rootkita je ponovno formatiranje pogona, uništavajući sve podatke. Nakon što je pogon ponovno formatiran, možete ponovno instalirati Microsoft® Windows™ pomoću kompaktnog diska koji ste dobili uz uređaj ili kupljene maloprodajne verzije.
Disk operacijskog sustava (OS) koji dolazi s računalom ponekad se naziva disk OEM (izvođača originalne opreme). Ovaj CD može se razlikovati od maloprodajne verzije po tome što može imati manje mogućnosti za popravak operacijskog sustava. U nekim slučajevima OEM CD dopušta samo nove instalacije. Međutim, trebao bi vam omogućiti pokretanje s CD-a i ponovno formatiranje pogona kako biste ga pripremili za novu instalaciju. Da biste se pokrenuli s CD-a, možda ćete morati promijeniti BIOS postavke matične ploče, koje su vjerojatno konfigurirane za podizanje s tvrdog diska.
U nekim slučajevima čak i nakon promjene postavki BIOS-a, OEM CD će proces pokretanja prebaciti na tvrdi disk čim otkrije da je instalirana kopija sustava Windows. Ako se to dogodi, možete koristiti uslužni program kao što je FreeDOS da napravite CD za podizanje sustava, dižući se na FreeDOS CD umjesto na Windows CD. Nakon pokretanja u FreeDOS, koristite naredbu fdisk za uklanjanje particija tvrdog diska. Time se uništavaju svi podaci na disku. Sada se možete pokrenuti s Windows OEM CD-a. Otkrit će pogon, pitat će vas želite li stvoriti particije i formatirati pogon, a zatim ponovno instalirati Microsoft® Windows™ umjesto vas.
Maloprodajne verzije sustava Windows (i neki OEM diskovi) dolaze s opcijom za popravak sustava Windows. Koristite ovu opciju kada želite ponovno instalirati Microsoft® Windows™ na prethodnu verziju kako biste zadržali postavke i instalirane programe. Proces traje gotovo koliko i nova instalacija, a alternativne verzije datoteka sustava Windows bit će zamijenjene izvornicima. To znači da ćete morati ponovno instalirati hitne popravke ili Microsoftova ažuriranja koja su izdana nakon što je CD proizveden nakon dovršetka postupka instalacije.
Uvijek je bolje ponovno instalirati Microsoft® Windows™ u odnosu na prethodnu verziju, ako se možete izvući, jer štedi neizmjerno vrijeme. Nova instalacija znači početak ispočetka, podešavanje sustava od nule, ponovno instaliranje svakog programa i ponovno konfiguriranje svakog programa po želji. To također znači zamjenu podatkovnih datoteka iz izvora sigurnosne kopije ili njihov gubitak ako sigurnosno kopiranje nije izvršeno. U nekim slučajevima, međutim, nova instalacija jedini je način za popravak oštećenog ili zaraženog sustava.