Macintosh®, Microsoft Windows® i Linux® su neki popularni sustavi stolnih računala. Dizajniran od strane Apple®, Mac OS® je relativno skup sustav poznat po svojoj jednostavnosti za korištenje. Microsoft Windows® je u razvoju od ranih 1980-ih i najrašireniji je računalni operativni sustav. Osim toga, Linux® je jedini široko korišteni operativni sustav otvorenog koda koji svatko može slobodno uređivati i distribuirati. Postoje i drugi stolni računalni sustavi, ali većina njih nije dovoljno popularna da bi se ozbiljno natjecala s velikom trojkom.
Kao jedan od najranijih sustava stolnih računala, Microsoft Windows® dolazi unaprijed instaliran na veliku većinu novih računala. Zapravo, čak i kada prilagođavaju osobno računalo (PC), neki proizvođači kupcima daju samo mogućnost izbora između različitih vrsta sustava Microsoft Windows®. Za korisnike s originalnim kopijama operativnog sustava, Microsoft® nudi besplatni antivirusni program, softver za uređivanje fotografija i još mnogo toga. Tvrtka obično prestaje podržavati određeni operativni sustav manje od jednog desetljeća nakon njegovog izdavanja, što znači da više ne kodira ažuriranja za greške ili upravljačke programe niti osigurava pokretanje novih programa.
Apple® računala pokreću operativni sustav pod nazivom Mac OS®, koji se često oglašava kao sustav koji je najprikladniji za korištenje. Za razliku od Microsoft Windows®, Mac OS® se ne prodaje na puno maloprodajnih računala. Umjesto toga, potencijalni korisnik mora naručiti izravno od Apple®, iako to dolazi s prednostima kupnje AppleCare® plana zaštite. Apple® računala i njihovi operativni sustavi razvili su kult sljedbenika zbog svoje jednostavnosti korištenja, kao što je činjenica da ne moraju kupiti zaštitu od virusa. Osim toga, iako Mac OS® nije otvorenog koda, korisnici mogu lako naučiti kreirati Mac OS® aplikacije za trgovinu s drugima.
Linux® je u razvoju od ranih 1990-ih uz pomoć tisuća ljudi. Može ga ažurirati svatko i ima vrlo posvećenu bazu obožavatelja koja pomaže novim korisnicima da se naviknu na operativni sustav. Linux® je najpopularniji izbor sustava kada su u pitanju poslužitelji i pokreće najbrža superračunala na svijetu.
Odabir među najpopularnijim stolnim računalnim sustavima može biti težak za nekoga tko nije razvio sklonost. Svi oni imaju svoje prednosti i nedostatke; na primjer, sustav koji se manje koristi vjerojatno ima manje mogućnosti igranja. Ne postoji “ispravno” ili “pogrešno” kada je u pitanju odabir operativnog sustava, već samo osobne preferencije.