Moždano deblo i mali mozak imaju pojedinačne uloge u kognitivnim funkcijama i motoričkoj kontroli. Slično ostalim dijelovima mozga, i tijelu u cjelini, moždano deblo i mali mozak imaju odvojene namjene. Kada se njihove svrhe kombiniraju, postaje očito koliko moždano deblo i mali mozak ovise jedno o drugom, i obrnuto, u cjelokupnom funkcioniranju mozga. Aktivnost može započeti u jednom području ili može biti istovremeno.
Smješten na stražnjoj strani glave i mozga, moždano deblo je dio na vrhu leđne moždine. Njegova glavna odgovornost je osigurati senzornu i motoričku kontrolu vrata i lica. Moždano deblo sadrži sve živčane veze koje idu od mozga do ostatka tijela. On kontrolira središnji živčani sustav, srčane funkcije i disanje. Osim toga, moždano deblo također igra ključnu ulogu u održavanju ciklusa spavanja i buđenja.
Nasuprot tome, mali mozak se nalazi u donjem dijelu mozga, rastegnut ispod obje hemisfere, s dijelom moždanog debla koji se nalazi ispred. Mali mozak također regulira motoričku kontrolu, koja na jedan način povezuje moždano deblo i mali mozak. Kognitivne funkcije, poput jezika, reguliraju mali mozak. Također igra ulogu u nekoliko emocionalnih odgovora. Iako moždano deblo ima primarnu kontrolu nad pokretanjem pokreta. Mali mozak pomaže pokretima pomažući u reguliranju vremena i koordinacije.
Moždano deblo i mali mozak mogu biti odgovorni za regulaciju različitih funkcija, ali također rade zajedno. Ako dođe do oštećenja malog mozga, malo je vjerojatno da bi paraliza bila posljedica jer glavnom motornom kontrolom upravlja moždano deblo. Oštećenje moždanog debla, međutim, može dovesti do paralize, ali može uzrokovati i nedostatak drugih funkcija. U nekim slučajevima, mali mozak može nadoknaditi male ozljede ili oštećenja moždanog debla, ali samo ako nije ometana veća kontrola. Sam po sebi, mali mozak nema sposobnost funkcioniranja kao moždano deblo.
Kada moždano deblo i mali mozak funkcioniraju normalno, ovise jedno o drugom. Moždano deblo ima najutjecajniju ulogu u funkcijama koje oba organa obavljaju. Mali mozak djeluje kao strukturna potpora pomažući u istim funkcijama kao i moždano deblo, ali ne u gotovo istom kapacitetu. Ako postoji problem s bilo kojim od organa, vjerojatno će utjecati na motoričku kontrolu.