Prednosti i nedostaci upotrebe morfija ovise o tome kako se morfij koristi. U kontroliranoj medicinskoj situaciji, gdje dugotrajno zlostavljanje nije vjerojatno ili moguće, određene negativne značajke poput ovisnosti i rizika od predoziranja mogu se eliminirati. Ipak, još uvijek postoje drugi negativni učinci morfija. S pozitivne strane, kada se morfij propisuje iz medicinskih razloga, ublažavanje boli je nužno, a morfij je vrlo učinkovit u ovom području. Iako je dobra ideja neovisno odvagnuti prednosti i nedostatke upotrebe morfija, postoji vrlo malo medicinskih situacija u kojima bi pacijent mogao odbiti upotrebu morfija ako mu je propisan.
Među pozitivnim učincima uporabe morfija najvažnije je ublažavanje boli. Morfij je vrlo dobar u ublažavanju jake boli, a iako postoje drugi lijekovi koji mogu učiniti istu stvar, liječnici obično imaju dobar razlog za propisivanje morfija, a ne druge zamjene. Točni razlozi razlikuju se od slučaja do slučaja. Postoji niz drugih upotreba morfija, koje mogu imati pozitivne osobine ovisno o slučaju.
S negativne strane, postoji niz osobina koje morfij čine neugodnim ili čak opasnim za korištenje. Poznato je da morfij izaziva veliku ovisnost, što može biti problematično kada se koristi bez nadzora. Ljudi također relativno brzo izgrađuju toleranciju na morfij, što dovodi do još veće upotrebe morfija. O tim se pitanjima mora razgovarati s liječnikom kada uzimate morfij tijekom duljeg vremenskog razdoblja ili izvan bolnice.
Izravniji negativni učinci morfija uključuju zatvor, glavobolje i mučninu. Neki ljudi doživljavaju tjeskobu, dok drugi doživljavaju euforiju. U gotovo svakoj situaciji u kojoj se morfij propisuje za bol, ove nuspojave će biti znatno podnošljivije od same boli. Kada se morfin preporučuje u druge svrhe, nuspojave mogu biti upečatljivije i nepodnošljive.
Korištenje morfija smatra se negativnom iz razloga koji gotovo u potpunosti nisu povezani s medicinom, ali ova povezanost stavlja pod sumnju medicinsku upotrebu morfija. Mnogi ljudi kojima je propisan morfij iz medicinskih razloga, posebno onih koji se odnose na bol, nikada ne razviju psihološke simptome ovisnosti, iako razviju fiziološku ovisnost. Odnos između morfija i heroina tjera mnoge ljude da sumnjaju da neće biti u stanju nositi se s morfinom, čak i pod nadzorom medicinskog stručnjaka. Važno je prepoznati da su medicinska uporaba droge i zlouporaba droge vrlo različite, a način na koji netko može odlučiti hoće li drogu uzimati rekreativno ne vrijedi u medicinskom kontekstu.