Minociklin i doksiciklin su polusintetski antibiotici širokog spektra dugog djelovanja u obitelji tetraciklina. Oba su bakteriostatska, jer sprječavaju razmnožavanje bakterija ometajući sintezu proteina. Koriste se za liječenje sličnih stanja, uključujući bakterijske i protozojske infekcije. Međutim, postoje mnoge razlike između ova dva lijeka. Imaju neke različite posebnosti, spektre djelovanja, nuspojave i sigurnosne probleme.
Doksiciklin se također koristi kao antihelmintik ili lijek protiv glista uz svoje primjene za bakterijske i protozojske infekcije. Bioaktivniji je lijek od ostalih tetraciklinskih antibiotika, uključujući minociklin. S druge strane, minociklin je lijek šireg spektra od doksiciklina i koristi se protiv šireg spektra bakterija. Minociklin se također koristi za liječenje reumatoidnog artritisa, a u toj ulozi ga preporučuje Američki koledž za reumatologiju.
Ostale razlike između minociklina i doksiciklina uključuju njihovu topljivost i druge kemijske karakteristike. Minociklin je topljiviji u mastima dok se doksiciklin lakše otapa u vodi. Iz tog razloga, minociklin lakše prelazi krvno-moždanu barijeru od doksiciklina i uzrokuje više nuspojava na središnji živčani sustav (CNS). Doksiciklin je, budući da je topljiviji u vodi, bolji izbor za infekcije mokraćnog sustava jer se njegovi aktivni metaboliti otapaju i izlučuju urinom. Ovaj lijek se ne smije uzimati s dodacima kalcija ili hranom bogatom kalcijem koja blokira apsorpciju, dok kod minociklina takvog ograničenja nema.
Neke nuspojave također se razlikuju između ovih lijekova. Veća topljivost minociklina u lipidima uzrokuje češće nuspojave središnjeg živčanog sustava, kao što su vrtoglavica i letargija. Poznata, ali rijetka nuspojava ovog lijeka je sekundarna intrakranijalna hipertenzija, ozbiljno stanje na koje prvo ukazuju glavobolje, dezorijentacija i vrtoglavica. Također je povezan s razvojem ili pogoršanjem sistemskog lupusa i raka štitnjače. Odnos između ova dva stanja i minociklina nije utvrđen kao uzročnik, ali stručnjaci upozoravaju na pažljivu procjenu tijekom uzimanja ovog lijeka.
Kao i kod svih tetraciklinskih antibiotika, i minociklin i doksiciklin mogu uzrokovati povećanu fotoosjetljivost – ili opekline – uz nominalno izlaganje suncu. Međutim, za razliku od drugih tetraciklinskih antibiotika koji ponekad mogu uzrokovati značajna oštećenja bubrega, oba se obično mogu sigurno koristiti u bolesnika s oštećenom funkcijom bubrega. Svi lijekovi iz tetraciklinske obitelji antibiotika nikada se ne smiju uzimati ili davati nakon isteka roka valjanosti lijekova. Sastojci koji se koriste u proizvodnji ovih lijekova s vremenom se razgrađuju i stvaraju toksine koji su posebno opasni za bubrege.