Neuspjeh podvezivanja jajovoda prilično je rijetka pojava, ali kada se dogodi, obično je rezultat jednog od nekoliko uobičajenih uzroka. Postupak se može izvesti pogrešno, ostavljajući prolaz za jajnu stanicu i spermu da putuju. U određenim slučajevima krajevi cijevi mogu ponovno srasti. Kada se jajovodi zatvore pomoću stezaljki ili prstenova, ti se uređaji mogu olabaviti ili skliznuti s mjesta, ponovno otvarajući cijevi. Žene također možda neće moći normalno zatrudnjeti, ali su sklonije izvanmaterničnim trudnoćama nakon podvezivanja jajovoda.
Jedan od najčešćih razloga neuspjeha ovog postupka je neispravno izvođenje. Ako kirurg nije dovoljno vješt da izvede ligaciju ispravno, ili naiđe na probleme s potrebnim instrumentom kao što je laparaskop, cijevi možda neće biti potpuno zatvorene. Mogu ostati djelomično deblokirani ili se uređaji koji se koriste za njihovo zatvaranje mogu postaviti na pogrešno mjesto. Ženama s određenim tjelesnim stanjima, poput pretilosti ili priraslica zdjelice, također može biti teže ispravno izvesti postupak. Ponekad kirurg može pogrešno zavezati okrugle ligamente u blizini maternice jer ih pogrešno smatraju jajovodima.
Drugi problem koji često uzrokuje kvar je ponovno pričvršćivanje cijevi. Ovaj proces, koji se naziva spontana reanastomoza, može se dogoditi ako krajevi odsječene cijevi nisu dovoljno udaljeni. Također mogu postojati problemi sa šavovima koji se koriste u postupku koji omogućuju da krajevi ponovno srastu. U nekim slučajevima, fistula ili endometrioza se mogu stvoriti na mjestu gdje su cijevi prerezane i stvoriti prolaz između njih.
Žene koje imaju određene vrste zahvata imaju veću vjerojatnost da će doživjeti neuspjeh podvezivanja jajovoda od drugih. Uređaji poput prstenova, petlji ili stezaljki koji drže epruvete zatvorene, ali ih zapravo ne oštećuju, mogu se postaviti pogrešno ili mogu skliznuti tako da više ne blokiraju u potpunosti prolaz spermija ili jajašca. Postupci koji više oštećuju cijevi rezanjem, stvaranjem ožiljaka ili spaljivanjem mnogo su manje vjerojatno da će propasti.
Iako postupak ligacije jajovoda može zaustaviti prolaz jajne stanice, ako postoji čak i mali prolaz otvoren, manji spermatozoidi bi mogli proći kroz njih. To može dovesti do ektopične trudnoće. Ne samo da je to neuspjeh postupka, već može biti i potencijalno opasno po život žene.