Nuspojave glukozamin kondroitina relativno su rijetke i obično su blage kada se pojave, iako se o svim negativnim simptomima koji počnu nakon uzimanja ovog lijeka treba prijaviti liječniku radi daljnje medicinske procjene. Neke od najčešće prijavljenih nuspojava glukozamin kondroitina uključuju gastrointestinalne smetnje, vrtoglavicu i glavobolje. Dijabetičari mogu doživjeti povišenje razine šećera u krvi kada koriste ovaj dodatak. Neke od ozbiljnijih potencijalnih nuspojava uključuju lupanje srca, oticanje ili respiratorni distres. O svim specifičnim pitanjima ili nedoumicama o mogućim nuspojavama glukozamin kondroitina u pojedinoj situaciji treba razgovarati s liječnikom ili drugim medicinskim stručnjakom.
Gastrointestinalni poremećaji su među najčešće prijavljenim nuspojavama glukozamin kondroitina. Može se javiti blaga do umjerena mučnina, sa ili bez povraćanja. Uzimanje ovog lijeka s hranom ili mlijekom može pomoći u smanjenju ozbiljnosti ovog simptoma. Neki ljudi koji uzimaju ovaj dodatak prehrani mogu doživjeti proljev, zatvor ili naizmjenične napade oboje. Oni koji uzimaju ovaj lijek također su prijavili žgaravicu, nadutost i pojačanu nadutost.
Glavobolja, vrtoglavica i pospanost moguće su nuspojave glukozamin kondroitina. Visoka razina šećera u krvi, poznata kao hiperglikemija, ponekad se može pojaviti kod pacijenata koji imaju dijabetes. Oni s respiratornim stanjima, kao što je astma, mogu primijetiti povećanje simptoma kada uzimaju ovaj lijek. Iako je većina ovih nuspojava obično blaga, o svim upornim ili neugodnim simptomima treba razgovarati s liječnikom.
Ozbiljnije nuspojave glukozamin kondroitina koje treba odmah prijaviti liječniku uključuju bol u prsima, otežano disanje ili značajan gubitak kose. Treba odmah prijaviti i oticanje ruku i stopala, jer to može biti znak smanjene funkcije bubrega. Oticanje lica, osobito ako je popraćeno problemima s disanjem ili otežanim gutanjem, može ukazivati na prisutnost potencijalno po život opasne alergijske reakcije poznate kao anafilaksija. Bol u trbuhu koji oponaša refluks kiseline treba procijeniti kako biste bili sigurni da nisu prisutne ozbiljne probavne komplikacije.
Neki ljudi možda neće moći sigurno koristiti dodatke glukozamin kondroitinu. Ako ti pacijenti odluče koristiti ovaj dodatak, preporučuje se pomno medicinsko praćenje. Oni koji uzimaju lijekove kao što su razrjeđivači krvi ili imaju u anamnezi poremećaje krvarenja trebali bi biti izuzetno oprezni kada koriste ovaj dodatak. Bolesnici koji imaju alergiju na školjke trebaju izbjegavati korištenje ovog proizvoda, jer se obično pravi od školjki ovih morskih stvorenja. Trudnicama i onima koji doje obično se savjetuje izbjegavanje ovog lijeka.