Postoje mnoge uobičajene upotrebe klonidin hidroklorida. Neke od njih su sankcionirale regulatorne agencije poput US Food and Drug Administration (FDA), a druge su još uvijek uobičajene, ali se smatraju izvan etikete. Dopuštene uporabe su za liječenje visokog krvnog tlaka i davanje samostalno ili s drugim lijekovima koji rješavaju poremećaj pažnje i hiperaktivnost (ADHD). Tretmani Off label su vrlo raznoliki i lijek se koristio za liječenje obilnog noćnog znojenja (noćne hiperhidroze) posebno povezano s menopauzom, tumora nadbubrežnih žlijezda, proljeva uzrokovanog dijabetesom, Touretteovog sindroma, boli koja utječe na živce, post traumatski stresni poremećaj (PTSP), granični poremećaj osobnosti i simptomi detoksikacije koji proizlaze iz prestanka pijenja, pušenja ili uporabe opioidnih droga.
Do 2010., jedina odobrena upotreba klonidin hidroklorida bila je lijek za krvni tlak za smanjenje hipertenzije. Istraživanja prije toga pokazala su korisnost lijeka u rješavanju simptoma ADHD-a. Kada se koristi sa stimulansom, poput metilfenidat hidroklorida, klonidin može pomoći u stvaranju opuštanja i promicanju boljeg sna. Istraživači su također otkrili da su neki oboljeli od ADHD-a dobro reagirali na sam lijek, te bi mogao pomoći u smanjenju simptoma hiperaktivnosti, impulzivnosti i nedostatka koncentracije. U nekim slučajevima, klonidin je jedini lijek koji se koristi za liječenje ADHD-a, a FDA je dala odobrenje za ovu upotrebu 2010.
To ne znači da lijek ne može biti učinkovit drugdje, ali jednostavno nije zadovoljio standarde koje je stvorila FDA za odobravanje lijeka za druge namjene. To nije neobično i postoje mnogi lijekovi koji su najpoznatiji po svojim off label funkcijama. Popis neoznačenih upotreba za klonidin hidroklorid je opsežan i povezan je s osnovnim djelovanjem lijeka, koji može liječiti razna stanja.
Klonidin je alfa-dva (a2) adrenergički receptor koji djeluje na tjelesne kemikalije kao što su norepinefrin, epinefrin i acetilkolin. Poznato je po raznim simptomima koje može uzrokovati u tijelu, poput snižavanja krvnog tlaka. Više od ovih fizičkih reakcija na klonidin uključuje smirivanje gastrointestinalnog trakta, smanjenje proizvodnje inzulina, smanjeno oslobađanje acetilkolina i norepinefrina i veću sklonost trombocita da se zgruda ili agregira. Ovo su samo neke od djelovanja klonidin hidroklorida, ali počinju objašnjavati zašto lijek može biti koristan u toliko različitih stanja.
Unatoč činjenici da klonidin hidroklorid ima polivalentni spektar liječenja, potrebno ga je uzimati s dužnim oprezom. Njegova sposobnost snižavanja krvnog tlaka može odgovarati opasno niskom otkucaju srca ili aritmijama. Blage nuspojave uključuju suhoću usta i očiju, seksualnu disfunkciju, želučane smetnje, glavobolju i bolove u zglobovima ili mišićima. Kao i svaki drugi lijek, ovaj lijek se propisuje pažljivo, pa čak i ako liječi stanje koje je odobreno ili ne obilježeno, nije nužno pravi izbor za sve pacijente.