Kao i svaki medicinski zahvat, vazektomija ima i prednosti i nedostatke. Primjerice, pozitivan aspekt zahvata je to što se obično izvodi kao ambulantna operacija bez potrebe za noćenjem u bolnici. To je također jedan od najučinkovitijih oblika kontrole rađanja, bolji od kondoma, kontracepcijskih pilula i podvezivanja jajovoda, što je sterilizacija za žene. Međutim, postupak vazektomije nije savršen oblik kontrole rađanja i obično ostavlja muškarcu malu šansu za oslobađanje sperme. Osim toga, operacija ponekad uzrokuje da muški pacijent pati od kronične boli.
Jedna od prednosti vazektomije je to što se smatra manjom operacijom i obično ne zahtijeva više od lokalne anestetike za utrnulost pacijentovog skrotuma. Ponekad se pacijentu daju lijekovi za smanjenje anksioznosti, što ga može učiniti pospanim i nesposobnim da se potpuno prisjeti postupka. Operacija se tada izvodi s pacijentom potpuno ili djelomično budnim. Otkriveno je nekoliko varijanti sterilizacije pacijenta, za koje se vjeruje da imaju brže vrijeme oporavka. Pacijent se općenito može vratiti na posao u roku od dan ili dva.
S druge strane, vazektomija je jedan od najboljih oblika kontrole rađanja jer je učinkovita 99.85%. Izuzetno je rijetko da sterilizirani muškarac zatrudni ženu nakon što zdravstveni djelatnik potvrdi da je njegov broj spermija jednak nuli. Muškarac ne mora koristiti drugu metodu kontrole rađanja da bi postigao ovu razinu učinkovitosti; postotak se odnosi na učinkovitost same sterilizacije.
Kronična bol u testisima ili oko tog područja moguća je komplikacija vazektomije. Ova bol može početi odmah, mjesecima ili godinama nakon operacije i mučiti čovjeka godinama, bilo stalno ili neprestano. Čak jedan od deset muškaraca koji su sterilizirani navodno doživi stanje kronične boli povezano s vazektomijom.
Još jedan nedostatak u vezi s vazektomijama je da one nisu 100% učinkovita metoda kontrole rađanja, niti štite od spolno prenosivih bolesti (STD). Još uvijek postoji mala šansa da sterilizirani muškarac može uspješno oploditi žensko jajašce. Zapravo, ta je šansa znatno veća tijekom prvih nekoliko mjeseci nakon vazektomije kada muškarac još uvijek ima spermu u testisima. Konačno, za razliku od kondoma, vazektomija uopće ne štiti od spolno prenosivih bolesti, stoga je oprez još uvijek neophodan kada postanete seksualno aktivni s novim partnerom ili partnerom koji može imati dodatne partnere.