Postoje mnoge razlike između vitke i agilne proizvodnje, uključujući stil proizvodnje, razine zaliha i mogućnosti prilagodbe. Tehnika vitke proizvodnje temelji se na strategiji masovne montažne linije s mješavinom zaposlenika i strojeva koji stvaraju proizvode od najmanjih komponenti do većih vanjskih sklopova. Nasuprot tome, agilna proizvodnja uglavnom ovisi o automatizaciji proizvodnje i modularnim dijelovima kako bi se formirao željeni proizvod.
Jedna glavna razlika između vitke i agilne proizvodnje je konfiguracija proizvodnje. Lean proizvodnja uvelike se oslanja na zaposlenike da fizički konstruiraju dio ili grupu dijelova; taj se dio proizvoda prosljeđuje drugom zaposleniku radi pričvršćivanja dodatnih komponenti. Automatizirani strojevi mogu se dodati duž montažne linije zaposlenika za precizniju proizvodnju, kao što je poravnavanje elektroničkih komponenti na tiskanoj pločici (PCB).
Za usporedbu, agilna proizvodnja koristi automatizaciju kao svoju glavnu proizvodnu strategiju. Smanjuje se broj zaposlenih radi uštede na troškovima rada; radnici koji ostaju uz proizvodnu liniju obično su prisutni radi podešavanja ili popravka robotskih strojeva kada je to potrebno, umjesto da fizički stvaraju proizvod. Kao rezultat toga, proizvodna linija je učinkovita i isplativa za poslovanje i potrošače.
Razine zaliha uvelike variraju između ova dva stila proizvodnje. Lean proizvodnja zahtijeva brojne male dijelove, od podložaka do vijaka, za izradu proizvoda; obilje raznih dijelova pridonosi visokim naknadama za skladištenje inventara. Nasuprot tome, agilna proizvodnja ovisi o modularnoj konstrukciji dijela. Ova standardizirana struktura dijelova omogućuje izradu različitih proizvoda s nekoliko istih modula koji se drže na zalihama što pridonosi nižoj razini ponude.
Lean i agile proizvodni procesi također se razlikuju po tome koliko se lako proizvodi mogu prilagoditi svakom sustavu. Promjena bilo kojeg dijela proizvoda u lean proizvodnji radi prilagođavanja njegovog rada ili izgleda zahtijeva redizajn unutarnjih i vanjskih dijelova, kao i generiranje prototipa za provjeru funkcionalnosti. Prilagođeni proizvodi iznimno su skupi zbog visokih troškova ovog istraživanja i dizajna. Osim toga, proizvodna linija se prekida tijekom ažuriranja kako bi se proizveo prilagođeni proizvod, što negativno utječe na normalno vrijeme proizvodnje i troškove.
Nasuprot tome, agilna proizvodnja može prihvatiti prilagođene narudžbe proizvoda budući da se modularna konstrukcija može brzo mijenjati. Proizvodnu liniju jednostavno treba prilagoditi ili dodati nove module postojećem proizvodu. Kao rezultat toga, potrošač može kupiti prilagođeni proizvod po konkurentnoj cijeni bez ometanja normalne poslovne proizvodne linije. Mnogi potrošači će tražiti proizvode od tvrtki koje se mogu specijalizirati za ovaj način. I vitki i agilni proizvodni procesi mogu zadovoljiti potrebe kupaca, ali s izravnim učinkom na cijenu finalnog proizvoda.