Velike boginje su akutni, zarazni virus koji je povijesno opustošio mnoge populacije. Uz zabrinutost oko bioterorizma koja raste krajem 20. stoljeća, neki ljudi su se pitali postoji li ovaj virus još uvijek. Kratak odgovor na ovo je da, ali dugi je malo kompliciraniji.
Godine 1967. Svjetska zdravstvena organizacija (WHO) najavila je globalnu kampanju za uklanjanje velikih boginja cijepljenjem. Mnogi zaposlenici WHO-a putovali su svijetom, tražeći slučajeve prirodnih bolesti i cijepili okolno stanovništvo kako bi spriječili njihovo širenje. Godine 1979. SZO je objavio da je dokumentiran posljednji divlji slučaj, koji je učinkovito pobijedio bolest. Međutim, nekoliko laboratorija zadržalo je uzorke bolesti za korištenje u istraživanju i razvoju cjepiva.
Znanstvenici su tvrdili da se uzorci živog virusa u laboratorijima ne bi trebali uništavati, jer bi jednog dana mogli biti potrebni za istraživanje. Kad bi, na primjer, netko uspio proizvesti velike boginje, možda iz krasta cjepiva prikupljenih prije 1979., to bi predstavljalo ozbiljnu prijetnju bioterorizmu. Osim toga, prirodni virus boginja mogao bi potencijalno evoluirati u smrtonosnu bolest, u kojem slučaju uzorci velikih boginja za usporedbu mogu biti vrlo korisni pri razvoju cjepiva.
Kao rezultat toga, dogovoreno je da će dva laboratorija zadržati uzorke, jedan u Sjedinjenim Državama i jedan u Rusiji. Američka zaliha cjepiva nalazi se u sjedištu Centra za kontrolu bolesti (CDC) u Atlanti, Georgia, gdje se strogo čuva i povremeno provjerava integritet. Ruska zaliha se čuva u Sibiru, u Državnom istraživačkom centru za virusologiju i biotehnologiju Vector, a ti uzorci bi također trebali biti pomno čuvani, iako su neke međunarodne organizacije postavile pitanja o sigurnosti na lokaciji.
Neki znanstvenici su također zabrinuti da bi druge zemlje mogle imati uzorke virusa ili da bi mogle imati pristup krastama od cjepiva, koje nose mali spremnik DNK koji bi se mogao sekvencirati. Neki od ovih uzoraka možda su također došli iz Vector-a, koji se borio sa sigurnosnim problemima. Devedesetih je to dovelo do povećane globalne zabrinutosti oko bioterorizma, budući da velik dio stanovništva nije bio cijepljen za tu bolest. Također je sugerirano da cjepivo možda neće trajati cijeli život, pa bi veliki dio svijeta mogao biti ranjiv.
Zbog toga je nekoliko zemalja provjerilo svoje zalihe cjepiva kako bi se uvjerile da su još uvijek dobre. Osim toga, nekoliko tvrtki čuva uzorke dijela virusa za korištenje u izradi cjepiva, osiguravajući da se s velikim boginjama može brzo nositi ako se ponovno pojave.